Protein–RNA interactions for Protein: Q14993

COL19A1, Collagen alpha-1(XIX) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL19A1Q14993 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
COL19A1Q14993 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
COL19A1Q14993 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
COL19A1Q14993 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
COL19A1Q14993 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
COL19A1Q14993 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
COL19A1Q14993 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
COL19A1Q14993 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
COL19A1Q14993 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
COL19A1Q14993 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
COL19A1Q14993 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
COL19A1Q14993 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
COL19A1Q14993 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
COL19A1Q14993 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
COL19A1Q14993 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
COL19A1Q14993 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
COL19A1Q14993 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
COL19A1Q14993 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
COL19A1Q14993 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
COL19A1Q14993 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
COL19A1Q14993 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
COL19A1Q14993 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
COL19A1Q14993 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
COL19A1Q14993 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
COL19A1Q14993 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
COL19A1Q14993 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
COL19A1Q14993 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
COL19A1Q14993 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
COL19A1Q14993 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
COL19A1Q14993 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
COL19A1Q14993 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
COL19A1Q14993 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
COL19A1Q14993 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
COL19A1Q14993 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
COL19A1Q14993 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
COL19A1Q14993 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
COL19A1Q14993 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
COL19A1Q14993 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
COL19A1Q14993 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
COL19A1Q14993 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
COL19A1Q14993 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
COL19A1Q14993 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
COL19A1Q14993 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
COL19A1Q14993 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
COL19A1Q14993 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
COL19A1Q14993 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
COL19A1Q14993 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
COL19A1Q14993 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
COL19A1Q14993 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
COL19A1Q14993 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
COL19A1Q14993 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
COL19A1Q14993 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
COL19A1Q14993 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
COL19A1Q14993 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
COL19A1Q14993 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
COL19A1Q14993 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
COL19A1Q14993 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
COL19A1Q14993 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
COL19A1Q14993 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
COL19A1Q14993 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
COL19A1Q14993 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
COL19A1Q14993 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
COL19A1Q14993 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
COL19A1Q14993 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
COL19A1Q14993 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
COL19A1Q14993 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
COL19A1Q14993 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
COL19A1Q14993 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
COL19A1Q14993 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
COL19A1Q14993 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
COL19A1Q14993 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
COL19A1Q14993 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
COL19A1Q14993 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
COL19A1Q14993 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
COL19A1Q14993 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
COL19A1Q14993 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
COL19A1Q14993 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
COL19A1Q14993 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
COL19A1Q14993 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
COL19A1Q14993 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
COL19A1Q14993 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
COL19A1Q14993 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
COL19A1Q14993 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
COL19A1Q14993 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
COL19A1Q14993 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
COL19A1Q14993 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
COL19A1Q14993 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
COL19A1Q14993 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
COL19A1Q14993 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
COL19A1Q14993 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
COL19A1Q14993 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
COL19A1Q14993 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
COL19A1Q14993 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
COL19A1Q14993 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
COL19A1Q14993 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
COL19A1Q14993 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
COL19A1Q14993 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
COL19A1Q14993 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
COL19A1Q14993 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
COL19A1Q14993 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms