Protein–RNA interactions for Protein: Q14956

GPNMB, Transmembrane glycoprotein NMB, humanhuman

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Length 572 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPNMBQ14956 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
GPNMBQ14956 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GPNMBQ14956 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
GPNMBQ14956 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GPNMBQ14956 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GPNMBQ14956 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GPNMBQ14956 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GPNMBQ14956 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GPNMBQ14956 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GPNMBQ14956 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GPNMBQ14956 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GPNMBQ14956 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GPNMBQ14956 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GPNMBQ14956 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GPNMBQ14956 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GPNMBQ14956 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GPNMBQ14956 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
GPNMBQ14956 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GPNMBQ14956 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GPNMBQ14956 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GPNMBQ14956 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
GPNMBQ14956 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
GPNMBQ14956 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GPNMBQ14956 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GPNMBQ14956 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GPNMBQ14956 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GPNMBQ14956 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GPNMBQ14956 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GPNMBQ14956 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
GPNMBQ14956 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GPNMBQ14956 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GPNMBQ14956 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GPNMBQ14956 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GPNMBQ14956 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GPNMBQ14956 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GPNMBQ14956 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GPNMBQ14956 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GPNMBQ14956 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GPNMBQ14956 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GPNMBQ14956 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GPNMBQ14956 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GPNMBQ14956 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
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GPNMBQ14956 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GPNMBQ14956 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
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GPNMBQ14956 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
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GPNMBQ14956 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
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GPNMBQ14956 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GPNMBQ14956 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GPNMBQ14956 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
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GPNMBQ14956 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GPNMBQ14956 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GPNMBQ14956 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
GPNMBQ14956 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GPNMBQ14956 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GPNMBQ14956 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GPNMBQ14956 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GPNMBQ14956 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
GPNMBQ14956 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GPNMBQ14956 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GPNMBQ14956 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GPNMBQ14956 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GPNMBQ14956 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GPNMBQ14956 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GPNMBQ14956 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GPNMBQ14956 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
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