Protein–RNA interactions for Protein: Q14938

NFIX, Nuclear factor 1 X-type, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIXQ14938 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NFIXQ14938 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NFIXQ14938 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
NFIXQ14938 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NFIXQ14938 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NFIXQ14938 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NFIXQ14938 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NFIXQ14938 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NFIXQ14938 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NFIXQ14938 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NFIXQ14938 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NFIXQ14938 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
NFIXQ14938 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NFIXQ14938 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NFIXQ14938 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NFIXQ14938 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NFIXQ14938 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NFIXQ14938 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NFIXQ14938 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NFIXQ14938 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NFIXQ14938 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NFIXQ14938 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NFIXQ14938 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NFIXQ14938 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NFIXQ14938 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NFIXQ14938 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NFIXQ14938 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NFIXQ14938 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NFIXQ14938 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NFIXQ14938 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NFIXQ14938 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NFIXQ14938 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NFIXQ14938 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NFIXQ14938 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NFIXQ14938 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NFIXQ14938 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NFIXQ14938 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NFIXQ14938 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NFIXQ14938 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NFIXQ14938 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NFIXQ14938 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NFIXQ14938 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NFIXQ14938 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NFIXQ14938 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NFIXQ14938 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NFIXQ14938 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NFIXQ14938 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NFIXQ14938 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NFIXQ14938 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NFIXQ14938 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NFIXQ14938 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NFIXQ14938 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NFIXQ14938 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NFIXQ14938 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NFIXQ14938 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NFIXQ14938 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NFIXQ14938 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NFIXQ14938 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NFIXQ14938 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NFIXQ14938 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NFIXQ14938 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
NFIXQ14938 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NFIXQ14938 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NFIXQ14938 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NFIXQ14938 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NFIXQ14938 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NFIXQ14938 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NFIXQ14938 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NFIXQ14938 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NFIXQ14938 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NFIXQ14938 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NFIXQ14938 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NFIXQ14938 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NFIXQ14938 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NFIXQ14938 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
NFIXQ14938 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NFIXQ14938 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NFIXQ14938 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NFIXQ14938 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NFIXQ14938 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NFIXQ14938 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NFIXQ14938 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NFIXQ14938 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NFIXQ14938 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NFIXQ14938 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NFIXQ14938 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NFIXQ14938 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
NFIXQ14938 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NFIXQ14938 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
NFIXQ14938 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NFIXQ14938 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NFIXQ14938 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NFIXQ14938 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NFIXQ14938 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NFIXQ14938 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NFIXQ14938 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NFIXQ14938 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NFIXQ14938 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NFIXQ14938 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NFIXQ14938 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
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