Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

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Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CUL4AQ13619 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CUL4AQ13619 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CUL4AQ13619 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CUL4AQ13619 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CUL4AQ13619 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CUL4AQ13619 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CUL4AQ13619 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CUL4AQ13619 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CUL4AQ13619 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CUL4AQ13619 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CUL4AQ13619 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CUL4AQ13619 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CUL4AQ13619 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CUL4AQ13619 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CUL4AQ13619 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CUL4AQ13619 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CUL4AQ13619 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CUL4AQ13619 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CUL4AQ13619 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CUL4AQ13619 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CUL4AQ13619 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CUL4AQ13619 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CUL4AQ13619 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CUL4AQ13619 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CUL4AQ13619 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CUL4AQ13619 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CUL4AQ13619 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CUL4AQ13619 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CUL4AQ13619 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CUL4AQ13619 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CUL4AQ13619 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CUL4AQ13619 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CUL4AQ13619 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CUL4AQ13619 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CUL4AQ13619 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CUL4AQ13619 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CUL4AQ13619 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CUL4AQ13619 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CUL4AQ13619 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CUL4AQ13619 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CUL4AQ13619 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CUL4AQ13619 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CUL4AQ13619 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CUL4AQ13619 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CUL4AQ13619 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CUL4AQ13619 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CUL4AQ13619 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CUL4AQ13619 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CUL4AQ13619 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CUL4AQ13619 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CUL4AQ13619 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CUL4AQ13619 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CUL4AQ13619 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CUL4AQ13619 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CUL4AQ13619 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CUL4AQ13619 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CUL4AQ13619 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CUL4AQ13619 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CUL4AQ13619 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CUL4AQ13619 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CUL4AQ13619 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CUL4AQ13619 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CUL4AQ13619 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CUL4AQ13619 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CUL4AQ13619 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CUL4AQ13619 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CUL4AQ13619 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CUL4AQ13619 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CUL4AQ13619 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CUL4AQ13619 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CUL4AQ13619 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CUL4AQ13619 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CUL4AQ13619 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CUL4AQ13619 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CUL4AQ13619 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CUL4AQ13619 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CUL4AQ13619 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CUL4AQ13619 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CUL4AQ13619 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CUL4AQ13619 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CUL4AQ13619 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CUL4AQ13619 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CUL4AQ13619 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CUL4AQ13619 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CUL4AQ13619 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CUL4AQ13619 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CUL4AQ13619 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CUL4AQ13619 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CUL4AQ13619 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CUL4AQ13619 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CUL4AQ13619 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CUL4AQ13619 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CUL4AQ13619 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CUL4AQ13619 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CUL4AQ13619 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CUL4AQ13619 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CUL4AQ13619 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CUL4AQ13619 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CUL4AQ13619 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
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