Protein–RNA interactions for Protein: Q13608

PEX6, Peroxisome assembly factor 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX6Q13608 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
PEX6Q13608 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PEX6Q13608 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PEX6Q13608 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PEX6Q13608 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PEX6Q13608 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PEX6Q13608 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
PEX6Q13608 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PEX6Q13608 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PEX6Q13608 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PEX6Q13608 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
PEX6Q13608 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
PEX6Q13608 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.75
PEX6Q13608 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PEX6Q13608 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PEX6Q13608 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
PEX6Q13608 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PEX6Q13608 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PEX6Q13608 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PEX6Q13608 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PEX6Q13608 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PEX6Q13608 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PEX6Q13608 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PEX6Q13608 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PEX6Q13608 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PEX6Q13608 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PEX6Q13608 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PEX6Q13608 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PEX6Q13608 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PEX6Q13608 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
PEX6Q13608 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PEX6Q13608 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PEX6Q13608 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PEX6Q13608 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PEX6Q13608 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
PEX6Q13608 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PEX6Q13608 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PEX6Q13608 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PEX6Q13608 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PEX6Q13608 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PEX6Q13608 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PEX6Q13608 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
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PEX6Q13608 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PEX6Q13608 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
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PEX6Q13608 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
PEX6Q13608 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
PEX6Q13608 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PEX6Q13608 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PEX6Q13608 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PEX6Q13608 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
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PEX6Q13608 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PEX6Q13608 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PEX6Q13608 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PEX6Q13608 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PEX6Q13608 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
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PEX6Q13608 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
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PEX6Q13608 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC19.74■□□□□ 0.75
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PEX6Q13608 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PEX6Q13608 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PEX6Q13608 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PEX6Q13608 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PEX6Q13608 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PEX6Q13608 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PEX6Q13608 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PEX6Q13608 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PEX6Q13608 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PEX6Q13608 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PEX6Q13608 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PEX6Q13608 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PEX6Q13608 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PEX6Q13608 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PEX6Q13608 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PEX6Q13608 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PEX6Q13608 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PEX6Q13608 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PEX6Q13608 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PEX6Q13608 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PEX6Q13608 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PEX6Q13608 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PEX6Q13608 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
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