Protein–RNA interactions for Protein: Q13515

BFSP2, Phakinin, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BFSP2Q13515 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BFSP2Q13515 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BFSP2Q13515 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
BFSP2Q13515 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
BFSP2Q13515 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
BFSP2Q13515 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
BFSP2Q13515 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
BFSP2Q13515 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BFSP2Q13515 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BFSP2Q13515 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
BFSP2Q13515 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
BFSP2Q13515 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BFSP2Q13515 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
BFSP2Q13515 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
BFSP2Q13515 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
BFSP2Q13515 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
BFSP2Q13515 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
BFSP2Q13515 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
BFSP2Q13515 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BFSP2Q13515 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
BFSP2Q13515 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
BFSP2Q13515 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
BFSP2Q13515 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BFSP2Q13515 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BFSP2Q13515 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
BFSP2Q13515 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
BFSP2Q13515 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BFSP2Q13515 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BFSP2Q13515 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BFSP2Q13515 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BFSP2Q13515 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BFSP2Q13515 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BFSP2Q13515 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BFSP2Q13515 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BFSP2Q13515 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BFSP2Q13515 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BFSP2Q13515 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BFSP2Q13515 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BFSP2Q13515 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BFSP2Q13515 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BFSP2Q13515 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BFSP2Q13515 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BFSP2Q13515 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BFSP2Q13515 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
BFSP2Q13515 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BFSP2Q13515 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BFSP2Q13515 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BFSP2Q13515 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BFSP2Q13515 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BFSP2Q13515 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BFSP2Q13515 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BFSP2Q13515 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BFSP2Q13515 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BFSP2Q13515 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BFSP2Q13515 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BFSP2Q13515 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BFSP2Q13515 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BFSP2Q13515 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BFSP2Q13515 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BFSP2Q13515 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BFSP2Q13515 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BFSP2Q13515 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BFSP2Q13515 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BFSP2Q13515 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BFSP2Q13515 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BFSP2Q13515 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BFSP2Q13515 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BFSP2Q13515 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BFSP2Q13515 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BFSP2Q13515 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BFSP2Q13515 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
BFSP2Q13515 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BFSP2Q13515 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BFSP2Q13515 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BFSP2Q13515 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BFSP2Q13515 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BFSP2Q13515 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BFSP2Q13515 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BFSP2Q13515 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BFSP2Q13515 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BFSP2Q13515 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BFSP2Q13515 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BFSP2Q13515 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
BFSP2Q13515 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
BFSP2Q13515 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BFSP2Q13515 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BFSP2Q13515 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BFSP2Q13515 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BFSP2Q13515 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
BFSP2Q13515 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BFSP2Q13515 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BFSP2Q13515 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BFSP2Q13515 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BFSP2Q13515 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BFSP2Q13515 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BFSP2Q13515 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BFSP2Q13515 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BFSP2Q13515 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BFSP2Q13515 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BFSP2Q13515 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
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