Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMAD4Q13485 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMAD4Q13485 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMAD4Q13485 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMAD4Q13485 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMAD4Q13485 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SMAD4Q13485 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SMAD4Q13485 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SMAD4Q13485 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SMAD4Q13485 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SMAD4Q13485 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SMAD4Q13485 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SMAD4Q13485 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SMAD4Q13485 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SMAD4Q13485 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SMAD4Q13485 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SMAD4Q13485 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SMAD4Q13485 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SMAD4Q13485 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SMAD4Q13485 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SMAD4Q13485 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SMAD4Q13485 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SMAD4Q13485 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SMAD4Q13485 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SMAD4Q13485 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SMAD4Q13485 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMAD4Q13485 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMAD4Q13485 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMAD4Q13485 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMAD4Q13485 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMAD4Q13485 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMAD4Q13485 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMAD4Q13485 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMAD4Q13485 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMAD4Q13485 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMAD4Q13485 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMAD4Q13485 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMAD4Q13485 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMAD4Q13485 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMAD4Q13485 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMAD4Q13485 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMAD4Q13485 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMAD4Q13485 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMAD4Q13485 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMAD4Q13485 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMAD4Q13485 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMAD4Q13485 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMAD4Q13485 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMAD4Q13485 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMAD4Q13485 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMAD4Q13485 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMAD4Q13485 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMAD4Q13485 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMAD4Q13485 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMAD4Q13485 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMAD4Q13485 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMAD4Q13485 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SMAD4Q13485 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMAD4Q13485 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMAD4Q13485 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMAD4Q13485 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMAD4Q13485 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMAD4Q13485 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMAD4Q13485 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMAD4Q13485 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMAD4Q13485 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMAD4Q13485 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SMAD4Q13485 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMAD4Q13485 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMAD4Q13485 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMAD4Q13485 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMAD4Q13485 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMAD4Q13485 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMAD4Q13485 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMAD4Q13485 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMAD4Q13485 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMAD4Q13485 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMAD4Q13485 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMAD4Q13485 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMAD4Q13485 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMAD4Q13485 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMAD4Q13485 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMAD4Q13485 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMAD4Q13485 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMAD4Q13485 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMAD4Q13485 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMAD4Q13485 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMAD4Q13485 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SMAD4Q13485 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMAD4Q13485 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMAD4Q13485 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SMAD4Q13485 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMAD4Q13485 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMAD4Q13485 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMAD4Q13485 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SMAD4Q13485 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMAD4Q13485 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SMAD4Q13485 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMAD4Q13485 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SMAD4Q13485 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
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