Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FOXE3Q13461 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FOXE3Q13461 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FOXE3Q13461 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FOXE3Q13461 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FOXE3Q13461 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FOXE3Q13461 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
FOXE3Q13461 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FOXE3Q13461 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FOXE3Q13461 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FOXE3Q13461 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FOXE3Q13461 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FOXE3Q13461 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FOXE3Q13461 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FOXE3Q13461 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FOXE3Q13461 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FOXE3Q13461 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FOXE3Q13461 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FOXE3Q13461 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FOXE3Q13461 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FOXE3Q13461 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FOXE3Q13461 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FOXE3Q13461 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXE3Q13461 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXE3Q13461 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXE3Q13461 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXE3Q13461 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXE3Q13461 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXE3Q13461 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXE3Q13461 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXE3Q13461 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXE3Q13461 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXE3Q13461 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXE3Q13461 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXE3Q13461 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXE3Q13461 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXE3Q13461 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXE3Q13461 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXE3Q13461 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXE3Q13461 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXE3Q13461 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXE3Q13461 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXE3Q13461 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXE3Q13461 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXE3Q13461 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXE3Q13461 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXE3Q13461 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXE3Q13461 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXE3Q13461 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXE3Q13461 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXE3Q13461 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXE3Q13461 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXE3Q13461 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXE3Q13461 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXE3Q13461 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXE3Q13461 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXE3Q13461 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXE3Q13461 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXE3Q13461 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXE3Q13461 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXE3Q13461 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXE3Q13461 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXE3Q13461 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXE3Q13461 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXE3Q13461 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXE3Q13461 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXE3Q13461 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXE3Q13461 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXE3Q13461 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXE3Q13461 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXE3Q13461 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXE3Q13461 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXE3Q13461 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXE3Q13461 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXE3Q13461 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXE3Q13461 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXE3Q13461 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXE3Q13461 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXE3Q13461 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXE3Q13461 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXE3Q13461 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXE3Q13461 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXE3Q13461 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXE3Q13461 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXE3Q13461 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXE3Q13461 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXE3Q13461 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXE3Q13461 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXE3Q13461 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXE3Q13461 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXE3Q13461 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXE3Q13461 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXE3Q13461 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXE3Q13461 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXE3Q13461 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXE3Q13461 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXE3Q13461 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXE3Q13461 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXE3Q13461 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXE3Q13461 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms