Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CLN3Q13286 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CLN3Q13286 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CLN3Q13286 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CLN3Q13286 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CLN3Q13286 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CLN3Q13286 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CLN3Q13286 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CLN3Q13286 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CLN3Q13286 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CLN3Q13286 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CLN3Q13286 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CLN3Q13286 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CLN3Q13286 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CLN3Q13286 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CLN3Q13286 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CLN3Q13286 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CLN3Q13286 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CLN3Q13286 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CLN3Q13286 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CLN3Q13286 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CLN3Q13286 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CLN3Q13286 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CLN3Q13286 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CLN3Q13286 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CLN3Q13286 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CLN3Q13286 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CLN3Q13286 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CLN3Q13286 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CLN3Q13286 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CLN3Q13286 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CLN3Q13286 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CLN3Q13286 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CLN3Q13286 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CLN3Q13286 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CLN3Q13286 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CLN3Q13286 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CLN3Q13286 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CLN3Q13286 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CLN3Q13286 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CLN3Q13286 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CLN3Q13286 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CLN3Q13286 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CLN3Q13286 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CLN3Q13286 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CLN3Q13286 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CLN3Q13286 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CLN3Q13286 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CLN3Q13286 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CLN3Q13286 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CLN3Q13286 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CLN3Q13286 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CLN3Q13286 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CLN3Q13286 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CLN3Q13286 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLN3Q13286 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CLN3Q13286 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLN3Q13286 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLN3Q13286 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLN3Q13286 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLN3Q13286 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLN3Q13286 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLN3Q13286 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLN3Q13286 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLN3Q13286 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLN3Q13286 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CLN3Q13286 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CLN3Q13286 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLN3Q13286 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CLN3Q13286 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CLN3Q13286 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CLN3Q13286 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLN3Q13286 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLN3Q13286 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLN3Q13286 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLN3Q13286 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLN3Q13286 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLN3Q13286 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLN3Q13286 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLN3Q13286 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLN3Q13286 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLN3Q13286 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLN3Q13286 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLN3Q13286 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLN3Q13286 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLN3Q13286 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLN3Q13286 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLN3Q13286 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLN3Q13286 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLN3Q13286 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLN3Q13286 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLN3Q13286 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLN3Q13286 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLN3Q13286 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLN3Q13286 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLN3Q13286 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CLN3Q13286 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLN3Q13286 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLN3Q13286 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLN3Q13286 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
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