Protein–RNA interactions for Protein: Q13148

TARDBP, TAR DNA-binding protein 43, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 414 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TARDBPQ13148 MBOAT2-206ENST00000474341 713 ntTSL 54.76□□□□□ -1.651e-6■■■■□ 21.6
TARDBPQ13148 MBOAT2-209ENST00000486484 1351 ntTSL 23.98□□□□□ -1.771e-6■■■■□ 21.6
TARDBPQ13148 MBOAT2-202ENST00000460786 550 ntTSL 32.71□□□□□ -1.981e-6■■■■□ 21.6
TARDBPQ13148 CPSF6-202ENST00000435070 6616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.247e-7■■■■□ 21.6
TARDBPQ13148 TCF12-201ENST00000267811 6061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.318e-7■■■■□ 21.6
TARDBPQ13148 ERI3-207ENST00000479101 367 ntTSL 313.24□□□□□ -0.295e-7■■■■□ 21.5
TARDBPQ13148 ERI3-208ENST00000489710 394 ntTSL 39.6□□□□□ -0.875e-7■■■■□ 21.5
TARDBPQ13148 ERI3-206ENST00000462341 320 ntTSL 34.93□□□□□ -1.625e-7■■■■□ 21.5
TARDBPQ13148 MPV17-222ENST00000621470 671 ntTSL 317.67■□□□□ 0.422e-10■■■■□ 21.5
TARDBPQ13148 MPV17-223ENST00000622003 794 ntTSL 516.64■□□□□ 0.252e-10■■■■□ 21.5
TARDBPQ13148 MPV17-221ENST00000621183 896 ntTSL 515.76■□□□□ 0.112e-10■■■■□ 21.5
TARDBPQ13148 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.092e-10■■■■□ 21.5
TARDBPQ13148 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.092e-10■■■■□ 21.5
TARDBPQ13148 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.022e-10■■■■□ 21.5
TARDBPQ13148 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.032e-10■■■■□ 21.5
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TARDBPQ13148 MPV17-219ENST00000617583 965 ntTSL 214.64□□□□□ -0.072e-10■■■■□ 21.5
TARDBPQ13148 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.082e-10■■■■□ 21.5
TARDBPQ13148 MPV17-211ENST00000426513 905 ntTSL 313.54□□□□□ -0.242e-10■■■■□ 21.5
TARDBPQ13148 MPV17-207ENST00000403262 665 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.292e-10■■■■□ 21.5
TARDBPQ13148 MPV17-209ENST00000405983 859 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.312e-10■■■■□ 21.5
TARDBPQ13148 MPV17-210ENST00000415514 597 ntTSL 513.09□□□□□ -0.312e-10■■■■□ 21.5
TARDBPQ13148 MPV17-202ENST00000357186 2011 ntTSL 2 BASIC8.98□□□□□ -0.972e-10■■■■□ 21.5
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TARDBPQ13148 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.156e-8■■■■□ 21.5
TARDBPQ13148 SMYD3-212ENST00000483072 466 ntTSL 28.65□□□□□ -1.022e-7■■■■□ 21.5
TARDBPQ13148 GALNT2-203ENST00000488903 593 ntTSL 225.87■■□□□ 1.732e-6■■■■□ 21.5
TARDBPQ13148 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.271e-6■■■■□ 21.5
TARDBPQ13148 ARHGAP6-208ENST00000495242 5303 ntTSL 1 (best)15.74■□□□□ 0.111e-6■■■■□ 21.5
TARDBPQ13148 ARHGAP6-206ENST00000489330 6299 ntTSL 214.62□□□□□ -0.071e-6■■■■□ 21.5
TARDBPQ13148 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.131e-6■■■■□ 21.5
TARDBPQ13148 ARHGAP6-205ENST00000380736 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.591e-6■■■■□ 21.5
TARDBPQ13148 EXOSC7-207ENST00000481405 768 ntTSL 330.34■■■□□ 2.451e-15■■■■□ 21.5
TARDBPQ13148 CLEC3B-203ENST00000490386 708 ntTSL 329.23■■■□□ 2.271e-15■■■■□ 21.5
TARDBPQ13148 EXOSC7-210ENST00000491476 1395 ntTSL 513.85□□□□□ -0.191e-15■■■■□ 21.5
TARDBPQ13148 EXOSC7-203ENST00000461361 1593 ntTSL 213.32□□□□□ -0.281e-15■■■■□ 21.5
TARDBPQ13148 EXOSC7-205ENST00000468667 831 ntTSL 512.99□□□□□ -0.331e-15■■■■□ 21.5
TARDBPQ13148 EXOSC7-201ENST00000265564 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.341e-15■■■■□ 21.5
TARDBPQ13148 EXOSC7-208ENST00000482004 559 ntTSL 410.09□□□□□ -0.791e-15■■■■□ 21.5
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TARDBPQ13148 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.553e-6■■■■□ 21.5
TARDBPQ13148 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.13e-6■■■■□ 21.5
TARDBPQ13148 ACACA-237ENST00000616317 9961 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.427e-9■■■■□ 21.5
TARDBPQ13148 ACACA-226ENST00000612895 9624 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.287e-9■■■■□ 21.5
TARDBPQ13148 ACACA-240ENST00000617649 7912 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.387e-9■■■■□ 21.5
TARDBPQ13148 ACACA-231ENST00000614428 9554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.387e-9■■■■□ 21.5
TARDBPQ13148 ZFAND6-218ENST00000561012 585 ntTSL 322.25■■□□□ 1.152e-7■■■■□ 21.4
TARDBPQ13148 ZFAND6-221ENST00000564367 582 ntTSL 317.49■□□□□ 0.392e-7■■■■□ 21.4
TARDBPQ13148 ZFAND6-220ENST00000561060 891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.522e-7■■■■□ 21.4
TARDBPQ13148 ZFAND6-216ENST00000560470 558 ntTSL 49.79□□□□□ -0.842e-7■■■■□ 21.4
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TARDBPQ13148 ZFAND6-209ENST00000558724 621 ntTSL 55.65□□□□□ -1.52e-7■■■■□ 21.4
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TARDBPQ13148 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.134e-6■■■■□ 21.4
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TARDBPQ13148 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.144e-6■■■■□ 21.4
TARDBPQ13148 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.194e-6■■■■□ 21.4
TARDBPQ13148 NFYC-206ENST00000372669 1005 ntTSL 513.28□□□□□ -0.284e-6■■■■□ 21.4
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TARDBPQ13148 NFYC-207ENST00000414185 677 ntTSL 39.96□□□□□ -0.824e-6■■■■□ 21.4
TARDBPQ13148 NFYC-221ENST00000525349 582 ntTSL 39.89□□□□□ -0.834e-6■■■■□ 21.4
TARDBPQ13148 NFYC-213ENST00000447388 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.894e-6■■■■□ 21.4
TARDBPQ13148 NFYC-201ENST00000308733 2158 ntTSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.94e-6■■■■□ 21.4
TARDBPQ13148 NFYC-208ENST00000416859 547 ntTSL 58.39□□□□□ -1.074e-6■■■■□ 21.4
TARDBPQ13148 SPG21-204ENST00000557795 747 ntTSL 515.17■□□□□ 0.025e-8■■■■□ 21.4
TARDBPQ13148 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.234e-8■■■■□ 21.4
TARDBPQ13148 SPG21-205ENST00000558339 582 ntTSL 422.63■■□□□ 1.214e-8■■■■□ 21.4
TARDBPQ13148 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.024e-8■■■■□ 21.4
TARDBPQ13148 SPG21-211ENST00000560564 607 ntTSL 416.3■□□□□ 0.24e-8■■■■□ 21.4
TARDBPQ13148 SPG21-213ENST00000561078 1520 ntTSL 514.63□□□□□ -0.074e-8■■■■□ 21.4
TARDBPQ13148 SPG21-207ENST00000558765 624 ntTSL 39.69□□□□□ -0.864e-8■■■■□ 21.4
TARDBPQ13148 SPG21-210ENST00000559677 553 ntTSL 39.21□□□□□ -0.944e-8■■■■□ 21.4
TARDBPQ13148 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.492e-6■■■■□ 21.4
TARDBPQ13148 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.492e-6■■■■□ 21.4
TARDBPQ13148 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.492e-6■■■■□ 21.4
TARDBPQ13148 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.252e-6■■■■□ 21.4
TARDBPQ13148 RNF111-205ENST00000559160 900 ntTSL 322.28■■□□□ 1.162e-6■■■■□ 21.4
TARDBPQ13148 NPLOC4-217ENST00000574897 2365 ntTSL 222.21■■□□□ 1.152e-6■■■■□ 21.4
TARDBPQ13148 AC069368.1-201ENST00000502574 1178 ntTSL 221.97■■□□□ 1.112e-6■■■■□ 21.4
TARDBPQ13148 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.042e-6■■■■□ 21.4
TARDBPQ13148 BBX-216ENST00000454540 392 ntTSL 521.37■■□□□ 1.012e-6■■■■□ 21.4
TARDBPQ13148 AP003108.2-202ENST00000541135 580 ntAPPRIS P1 TSL 419.46■□□□□ 0.712e-6■■■■□ 21.4
TARDBPQ13148 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.622e-6■■■■□ 21.4
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