Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CHAF1AQ13111 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CHAF1AQ13111 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CHAF1AQ13111 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CHAF1AQ13111 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CHAF1AQ13111 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
CHAF1AQ13111 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CHAF1AQ13111 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CHAF1AQ13111 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CHAF1AQ13111 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CHAF1AQ13111 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
CHAF1AQ13111 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CHAF1AQ13111 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHAF1AQ13111 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHAF1AQ13111 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHAF1AQ13111 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHAF1AQ13111 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHAF1AQ13111 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHAF1AQ13111 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHAF1AQ13111 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHAF1AQ13111 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHAF1AQ13111 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHAF1AQ13111 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHAF1AQ13111 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHAF1AQ13111 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHAF1AQ13111 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHAF1AQ13111 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHAF1AQ13111 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHAF1AQ13111 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CHAF1AQ13111 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHAF1AQ13111 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHAF1AQ13111 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CHAF1AQ13111 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHAF1AQ13111 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHAF1AQ13111 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHAF1AQ13111 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CHAF1AQ13111 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHAF1AQ13111 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHAF1AQ13111 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHAF1AQ13111 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHAF1AQ13111 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHAF1AQ13111 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHAF1AQ13111 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHAF1AQ13111 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHAF1AQ13111 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHAF1AQ13111 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CHAF1AQ13111 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CHAF1AQ13111 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CHAF1AQ13111 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CHAF1AQ13111 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CHAF1AQ13111 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CHAF1AQ13111 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CHAF1AQ13111 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CHAF1AQ13111 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CHAF1AQ13111 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CHAF1AQ13111 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CHAF1AQ13111 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CHAF1AQ13111 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CHAF1AQ13111 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CHAF1AQ13111 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CHAF1AQ13111 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CHAF1AQ13111 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CHAF1AQ13111 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CHAF1AQ13111 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CHAF1AQ13111 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CHAF1AQ13111 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHAF1AQ13111 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHAF1AQ13111 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHAF1AQ13111 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHAF1AQ13111 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHAF1AQ13111 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHAF1AQ13111 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHAF1AQ13111 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHAF1AQ13111 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHAF1AQ13111 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHAF1AQ13111 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHAF1AQ13111 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CHAF1AQ13111 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHAF1AQ13111 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHAF1AQ13111 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHAF1AQ13111 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHAF1AQ13111 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHAF1AQ13111 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CHAF1AQ13111 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
CHAF1AQ13111 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CHAF1AQ13111 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
CHAF1AQ13111 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHAF1AQ13111 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHAF1AQ13111 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHAF1AQ13111 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CHAF1AQ13111 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CHAF1AQ13111 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHAF1AQ13111 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CHAF1AQ13111 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHAF1AQ13111 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHAF1AQ13111 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHAF1AQ13111 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHAF1AQ13111 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHAF1AQ13111 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHAF1AQ13111 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
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