Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

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Length 1,718 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC33.44■■■□□ 2.94
PRDM2Q13029 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
PRDM2Q13029 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC33.44■■■□□ 2.94
PRDM2Q13029 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
PRDM2Q13029 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
PRDM2Q13029 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
PRDM2Q13029 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
PRDM2Q13029 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
PRDM2Q13029 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
PRDM2Q13029 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
PRDM2Q13029 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
PRDM2Q13029 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
PRDM2Q13029 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
PRDM2Q13029 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
PRDM2Q13029 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
PRDM2Q13029 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
PRDM2Q13029 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
PRDM2Q13029 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
PRDM2Q13029 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
PRDM2Q13029 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
PRDM2Q13029 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
PRDM2Q13029 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
PRDM2Q13029 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
PRDM2Q13029 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
PRDM2Q13029 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
PRDM2Q13029 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
PRDM2Q13029 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC33.42■■■□□ 2.94
PRDM2Q13029 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
PRDM2Q13029 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
PRDM2Q13029 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
PRDM2Q13029 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
PRDM2Q13029 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
PRDM2Q13029 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
PRDM2Q13029 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
PRDM2Q13029 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
PRDM2Q13029 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
PRDM2Q13029 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
PRDM2Q13029 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
PRDM2Q13029 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
PRDM2Q13029 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
PRDM2Q13029 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
PRDM2Q13029 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
PRDM2Q13029 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
PRDM2Q13029 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
PRDM2Q13029 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
PRDM2Q13029 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
PRDM2Q13029 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
PRDM2Q13029 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
PRDM2Q13029 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
PRDM2Q13029 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
PRDM2Q13029 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
PRDM2Q13029 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC33.4■■■□□ 2.94
PRDM2Q13029 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC33.4■■■□□ 2.94
PRDM2Q13029 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
PRDM2Q13029 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
PRDM2Q13029 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
PRDM2Q13029 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
PRDM2Q13029 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.4■■■□□ 2.94
PRDM2Q13029 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC33.4■■■□□ 2.94
PRDM2Q13029 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
PRDM2Q13029 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
PRDM2Q13029 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
PRDM2Q13029 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
PRDM2Q13029 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
PRDM2Q13029 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
PRDM2Q13029 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
PRDM2Q13029 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
PRDM2Q13029 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
PRDM2Q13029 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
PRDM2Q13029 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC33.39■■■□□ 2.94
PRDM2Q13029 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
PRDM2Q13029 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
PRDM2Q13029 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
PRDM2Q13029 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
PRDM2Q13029 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
PRDM2Q13029 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
PRDM2Q13029 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
PRDM2Q13029 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
PRDM2Q13029 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
PRDM2Q13029 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
PRDM2Q13029 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
PRDM2Q13029 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
PRDM2Q13029 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
PRDM2Q13029 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
PRDM2Q13029 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
PRDM2Q13029 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
PRDM2Q13029 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
PRDM2Q13029 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
PRDM2Q13029 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
PRDM2Q13029 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
PRDM2Q13029 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
PRDM2Q13029 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
PRDM2Q13029 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC33.37■■■□□ 2.93
PRDM2Q13029 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
PRDM2Q13029 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
PRDM2Q13029 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
PRDM2Q13029 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
PRDM2Q13029 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
PRDM2Q13029 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
PRDM2Q13029 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC33.36■■■□□ 2.93
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