Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPN13Q12923 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPN13Q12923 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPN13Q12923 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPN13Q12923 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPN13Q12923 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPN13Q12923 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPN13Q12923 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPN13Q12923 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPN13Q12923 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPN13Q12923 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPN13Q12923 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPN13Q12923 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPN13Q12923 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPN13Q12923 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPN13Q12923 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPN13Q12923 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPN13Q12923 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PTPN13Q12923 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPN13Q12923 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPN13Q12923 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPN13Q12923 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPN13Q12923 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPN13Q12923 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPN13Q12923 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPN13Q12923 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPN13Q12923 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPN13Q12923 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPN13Q12923 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPN13Q12923 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPN13Q12923 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPN13Q12923 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPN13Q12923 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPN13Q12923 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPN13Q12923 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPN13Q12923 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPN13Q12923 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPN13Q12923 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPN13Q12923 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPN13Q12923 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPN13Q12923 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPN13Q12923 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPN13Q12923 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPN13Q12923 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTPN13Q12923 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTPN13Q12923 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PTPN13Q12923 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTPN13Q12923 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTPN13Q12923 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PTPN13Q12923 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTPN13Q12923 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTPN13Q12923 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTPN13Q12923 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTPN13Q12923 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTPN13Q12923 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
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PTPN13Q12923 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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PTPN13Q12923 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTPN13Q12923 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PTPN13Q12923 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTPN13Q12923 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTPN13Q12923 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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PTPN13Q12923 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTPN13Q12923 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTPN13Q12923 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTPN13Q12923 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTPN13Q12923 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTPN13Q12923 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTPN13Q12923 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTPN13Q12923 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
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PTPN13Q12923 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTPN13Q12923 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTPN13Q12923 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTPN13Q12923 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTPN13Q12923 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTPN13Q12923 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTPN13Q12923 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
PTPN13Q12923 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
PTPN13Q12923 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTPN13Q12923 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
PTPN13Q12923 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPN13Q12923 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPN13Q12923 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPN13Q12923 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPN13Q12923 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPN13Q12923 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPN13Q12923 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPN13Q12923 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPN13Q12923 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPN13Q12923 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPN13Q12923 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPN13Q12923 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPN13Q12923 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPN13Q12923 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPN13Q12923 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPN13Q12923 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPN13Q12923 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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