Protein–RNA interactions for Protein: Q12824

SMARCB1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily B member 1, humanhuman

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCB1Q12824 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SMARCB1Q12824 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SMARCB1Q12824 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SMARCB1Q12824 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SMARCB1Q12824 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SMARCB1Q12824 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SMARCB1Q12824 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SMARCB1Q12824 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SMARCB1Q12824 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SMARCB1Q12824 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SMARCB1Q12824 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
SMARCB1Q12824 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SMARCB1Q12824 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SMARCB1Q12824 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SMARCB1Q12824 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SMARCB1Q12824 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SMARCB1Q12824 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SMARCB1Q12824 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SMARCB1Q12824 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SMARCB1Q12824 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
SMARCB1Q12824 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
SMARCB1Q12824 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SMARCB1Q12824 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SMARCB1Q12824 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SMARCB1Q12824 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SMARCB1Q12824 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SMARCB1Q12824 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
SMARCB1Q12824 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
SMARCB1Q12824 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SMARCB1Q12824 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SMARCB1Q12824 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SMARCB1Q12824 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
SMARCB1Q12824 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
SMARCB1Q12824 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SMARCB1Q12824 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SMARCB1Q12824 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SMARCB1Q12824 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SMARCB1Q12824 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SMARCB1Q12824 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SMARCB1Q12824 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SMARCB1Q12824 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SMARCB1Q12824 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SMARCB1Q12824 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SMARCB1Q12824 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SMARCB1Q12824 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SMARCB1Q12824 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SMARCB1Q12824 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SMARCB1Q12824 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SMARCB1Q12824 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SMARCB1Q12824 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SMARCB1Q12824 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SMARCB1Q12824 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
SMARCB1Q12824 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SMARCB1Q12824 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SMARCB1Q12824 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SMARCB1Q12824 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SMARCB1Q12824 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMARCB1Q12824 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMARCB1Q12824 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMARCB1Q12824 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMARCB1Q12824 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMARCB1Q12824 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMARCB1Q12824 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMARCB1Q12824 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMARCB1Q12824 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMARCB1Q12824 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMARCB1Q12824 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMARCB1Q12824 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMARCB1Q12824 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMARCB1Q12824 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SMARCB1Q12824 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMARCB1Q12824 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMARCB1Q12824 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMARCB1Q12824 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMARCB1Q12824 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMARCB1Q12824 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SMARCB1Q12824 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMARCB1Q12824 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMARCB1Q12824 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SMARCB1Q12824 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMARCB1Q12824 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SMARCB1Q12824 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMARCB1Q12824 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SMARCB1Q12824 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMARCB1Q12824 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMARCB1Q12824 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMARCB1Q12824 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMARCB1Q12824 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMARCB1Q12824 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMARCB1Q12824 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMARCB1Q12824 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMARCB1Q12824 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMARCB1Q12824 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMARCB1Q12824 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SMARCB1Q12824 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMARCB1Q12824 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMARCB1Q12824 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMARCB1Q12824 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMARCB1Q12824 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMARCB1Q12824 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
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