Protein–RNA interactions for Protein: Q08AF3

SLFN5, Schlafen family member 5, humanhuman

Predictions only

Length 891 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN5Q08AF3 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLFN5Q08AF3 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SLFN5Q08AF3 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SLFN5Q08AF3 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SLFN5Q08AF3 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SLFN5Q08AF3 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
SLFN5Q08AF3 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SLFN5Q08AF3 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLFN5Q08AF3 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLFN5Q08AF3 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLFN5Q08AF3 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLFN5Q08AF3 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLFN5Q08AF3 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLFN5Q08AF3 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLFN5Q08AF3 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
SLFN5Q08AF3 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLFN5Q08AF3 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLFN5Q08AF3 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLFN5Q08AF3 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLFN5Q08AF3 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLFN5Q08AF3 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLFN5Q08AF3 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLFN5Q08AF3 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLFN5Q08AF3 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLFN5Q08AF3 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLFN5Q08AF3 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLFN5Q08AF3 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLFN5Q08AF3 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLFN5Q08AF3 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLFN5Q08AF3 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLFN5Q08AF3 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLFN5Q08AF3 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SLFN5Q08AF3 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLFN5Q08AF3 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLFN5Q08AF3 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLFN5Q08AF3 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLFN5Q08AF3 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLFN5Q08AF3 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLFN5Q08AF3 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLFN5Q08AF3 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLFN5Q08AF3 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLFN5Q08AF3 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLFN5Q08AF3 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLFN5Q08AF3 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLFN5Q08AF3 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLFN5Q08AF3 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLFN5Q08AF3 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLFN5Q08AF3 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLFN5Q08AF3 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLFN5Q08AF3 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLFN5Q08AF3 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLFN5Q08AF3 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLFN5Q08AF3 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLFN5Q08AF3 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLFN5Q08AF3 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLFN5Q08AF3 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLFN5Q08AF3 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLFN5Q08AF3 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLFN5Q08AF3 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLFN5Q08AF3 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLFN5Q08AF3 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SLFN5Q08AF3 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLFN5Q08AF3 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLFN5Q08AF3 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLFN5Q08AF3 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLFN5Q08AF3 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLFN5Q08AF3 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLFN5Q08AF3 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLFN5Q08AF3 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLFN5Q08AF3 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLFN5Q08AF3 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
SLFN5Q08AF3 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLFN5Q08AF3 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLFN5Q08AF3 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
SLFN5Q08AF3 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
SLFN5Q08AF3 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLFN5Q08AF3 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLFN5Q08AF3 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLFN5Q08AF3 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLFN5Q08AF3 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLFN5Q08AF3 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLFN5Q08AF3 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLFN5Q08AF3 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLFN5Q08AF3 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLFN5Q08AF3 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLFN5Q08AF3 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLFN5Q08AF3 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLFN5Q08AF3 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLFN5Q08AF3 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLFN5Q08AF3 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLFN5Q08AF3 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLFN5Q08AF3 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLFN5Q08AF3 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLFN5Q08AF3 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLFN5Q08AF3 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLFN5Q08AF3 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLFN5Q08AF3 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLFN5Q08AF3 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLFN5Q08AF3 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLFN5Q08AF3 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms