Protein–RNA interactions for Protein: Q08623

PUDP, Pseudouridine-5'-phosphatase, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUDPQ08623 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PUDPQ08623 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PUDPQ08623 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PUDPQ08623 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PUDPQ08623 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PUDPQ08623 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PUDPQ08623 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PUDPQ08623 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PUDPQ08623 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PUDPQ08623 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PUDPQ08623 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PUDPQ08623 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PUDPQ08623 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PUDPQ08623 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PUDPQ08623 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PUDPQ08623 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PUDPQ08623 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PUDPQ08623 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PUDPQ08623 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PUDPQ08623 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PUDPQ08623 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PUDPQ08623 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PUDPQ08623 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PUDPQ08623 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PUDPQ08623 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PUDPQ08623 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PUDPQ08623 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PUDPQ08623 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PUDPQ08623 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PUDPQ08623 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PUDPQ08623 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PUDPQ08623 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PUDPQ08623 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PUDPQ08623 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PUDPQ08623 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PUDPQ08623 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PUDPQ08623 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PUDPQ08623 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PUDPQ08623 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PUDPQ08623 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PUDPQ08623 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PUDPQ08623 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PUDPQ08623 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PUDPQ08623 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PUDPQ08623 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PUDPQ08623 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PUDPQ08623 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PUDPQ08623 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PUDPQ08623 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PUDPQ08623 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
PUDPQ08623 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PUDPQ08623 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PUDPQ08623 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PUDPQ08623 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PUDPQ08623 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PUDPQ08623 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PUDPQ08623 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PUDPQ08623 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PUDPQ08623 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PUDPQ08623 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PUDPQ08623 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PUDPQ08623 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PUDPQ08623 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PUDPQ08623 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PUDPQ08623 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PUDPQ08623 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PUDPQ08623 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PUDPQ08623 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PUDPQ08623 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PUDPQ08623 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PUDPQ08623 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PUDPQ08623 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PUDPQ08623 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PUDPQ08623 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PUDPQ08623 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PUDPQ08623 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PUDPQ08623 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PUDPQ08623 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PUDPQ08623 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PUDPQ08623 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PUDPQ08623 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PUDPQ08623 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PUDPQ08623 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PUDPQ08623 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PUDPQ08623 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PUDPQ08623 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PUDPQ08623 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PUDPQ08623 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PUDPQ08623 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PUDPQ08623 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PUDPQ08623 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PUDPQ08623 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PUDPQ08623 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PUDPQ08623 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PUDPQ08623 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PUDPQ08623 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PUDPQ08623 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PUDPQ08623 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PUDPQ08623 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PUDPQ08623 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms