Protein–RNA interactions for Protein: Q08493

PDE4C, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4C, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4CQ08493 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDE4CQ08493 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDE4CQ08493 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDE4CQ08493 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDE4CQ08493 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDE4CQ08493 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDE4CQ08493 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDE4CQ08493 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDE4CQ08493 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDE4CQ08493 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDE4CQ08493 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDE4CQ08493 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDE4CQ08493 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDE4CQ08493 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDE4CQ08493 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDE4CQ08493 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDE4CQ08493 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDE4CQ08493 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDE4CQ08493 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDE4CQ08493 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDE4CQ08493 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDE4CQ08493 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDE4CQ08493 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDE4CQ08493 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDE4CQ08493 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDE4CQ08493 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDE4CQ08493 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDE4CQ08493 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDE4CQ08493 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDE4CQ08493 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDE4CQ08493 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDE4CQ08493 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDE4CQ08493 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDE4CQ08493 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDE4CQ08493 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDE4CQ08493 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PDE4CQ08493 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PDE4CQ08493 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PDE4CQ08493 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDE4CQ08493 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDE4CQ08493 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDE4CQ08493 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDE4CQ08493 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDE4CQ08493 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDE4CQ08493 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDE4CQ08493 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDE4CQ08493 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDE4CQ08493 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PDE4CQ08493 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDE4CQ08493 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDE4CQ08493 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDE4CQ08493 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDE4CQ08493 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDE4CQ08493 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDE4CQ08493 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDE4CQ08493 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDE4CQ08493 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDE4CQ08493 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDE4CQ08493 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDE4CQ08493 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDE4CQ08493 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDE4CQ08493 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDE4CQ08493 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PDE4CQ08493 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PDE4CQ08493 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDE4CQ08493 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDE4CQ08493 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDE4CQ08493 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDE4CQ08493 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDE4CQ08493 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDE4CQ08493 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDE4CQ08493 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDE4CQ08493 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDE4CQ08493 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDE4CQ08493 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDE4CQ08493 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDE4CQ08493 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDE4CQ08493 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDE4CQ08493 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDE4CQ08493 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDE4CQ08493 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDE4CQ08493 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDE4CQ08493 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDE4CQ08493 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDE4CQ08493 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDE4CQ08493 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDE4CQ08493 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDE4CQ08493 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDE4CQ08493 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDE4CQ08493 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PDE4CQ08493 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDE4CQ08493 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDE4CQ08493 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDE4CQ08493 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDE4CQ08493 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDE4CQ08493 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDE4CQ08493 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDE4CQ08493 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDE4CQ08493 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDE4CQ08493 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms