Protein–RNA interactions for Protein: Q02487

DSC2, Desmocollin-2, humanhuman

Predictions only

Length 901 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC2Q02487 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
DSC2Q02487 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
DSC2Q02487 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
DSC2Q02487 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
DSC2Q02487 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
DSC2Q02487 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
DSC2Q02487 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
DSC2Q02487 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
DSC2Q02487 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
DSC2Q02487 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
DSC2Q02487 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
DSC2Q02487 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
DSC2Q02487 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
DSC2Q02487 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
DSC2Q02487 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
DSC2Q02487 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
DSC2Q02487 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
DSC2Q02487 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
DSC2Q02487 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
DSC2Q02487 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
DSC2Q02487 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC19.81■□□□□ 0.76
DSC2Q02487 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
DSC2Q02487 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
DSC2Q02487 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
DSC2Q02487 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
DSC2Q02487 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
DSC2Q02487 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
DSC2Q02487 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
DSC2Q02487 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
DSC2Q02487 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
DSC2Q02487 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
DSC2Q02487 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
DSC2Q02487 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
DSC2Q02487 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
DSC2Q02487 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
DSC2Q02487 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
DSC2Q02487 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
DSC2Q02487 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
DSC2Q02487 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
DSC2Q02487 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
DSC2Q02487 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
DSC2Q02487 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
DSC2Q02487 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
DSC2Q02487 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
DSC2Q02487 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
DSC2Q02487 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC19.8■□□□□ 0.76
DSC2Q02487 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC19.8■□□□□ 0.76
DSC2Q02487 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
DSC2Q02487 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
DSC2Q02487 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
DSC2Q02487 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
DSC2Q02487 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
DSC2Q02487 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
DSC2Q02487 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
DSC2Q02487 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
DSC2Q02487 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
DSC2Q02487 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
DSC2Q02487 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
DSC2Q02487 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
DSC2Q02487 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
DSC2Q02487 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
DSC2Q02487 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
DSC2Q02487 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
DSC2Q02487 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
DSC2Q02487 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
DSC2Q02487 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
DSC2Q02487 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
DSC2Q02487 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
DSC2Q02487 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
DSC2Q02487 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
DSC2Q02487 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
DSC2Q02487 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
DSC2Q02487 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
DSC2Q02487 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
DSC2Q02487 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
DSC2Q02487 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
DSC2Q02487 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
DSC2Q02487 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
DSC2Q02487 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
DSC2Q02487 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
DSC2Q02487 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
DSC2Q02487 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
DSC2Q02487 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
DSC2Q02487 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
DSC2Q02487 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
DSC2Q02487 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
DSC2Q02487 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
DSC2Q02487 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
DSC2Q02487 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
DSC2Q02487 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
DSC2Q02487 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
DSC2Q02487 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
DSC2Q02487 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
DSC2Q02487 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
DSC2Q02487 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
DSC2Q02487 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
DSC2Q02487 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
DSC2Q02487 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
DSC2Q02487 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
DSC2Q02487 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms