Protein–RNA interactions for Protein: Q01726

MC1R, Melanocyte-stimulating hormone receptor, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MC1RQ01726 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
MC1RQ01726 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MC1RQ01726 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
MC1RQ01726 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
MC1RQ01726 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MC1RQ01726 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
MC1RQ01726 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MC1RQ01726 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
MC1RQ01726 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
MC1RQ01726 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
MC1RQ01726 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
MC1RQ01726 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MC1RQ01726 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MC1RQ01726 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
MC1RQ01726 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
MC1RQ01726 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MC1RQ01726 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
MC1RQ01726 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MC1RQ01726 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
MC1RQ01726 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
MC1RQ01726 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MC1RQ01726 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MC1RQ01726 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
MC1RQ01726 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
MC1RQ01726 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
MC1RQ01726 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
MC1RQ01726 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MC1RQ01726 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
MC1RQ01726 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
MC1RQ01726 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
MC1RQ01726 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
MC1RQ01726 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
MC1RQ01726 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
MC1RQ01726 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
MC1RQ01726 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
MC1RQ01726 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MC1RQ01726 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MC1RQ01726 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MC1RQ01726 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
MC1RQ01726 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MC1RQ01726 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MC1RQ01726 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
MC1RQ01726 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
MC1RQ01726 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MC1RQ01726 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
MC1RQ01726 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MC1RQ01726 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MC1RQ01726 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MC1RQ01726 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
MC1RQ01726 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
MC1RQ01726 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
MC1RQ01726 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MC1RQ01726 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MC1RQ01726 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MC1RQ01726 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
MC1RQ01726 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
MC1RQ01726 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
MC1RQ01726 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
MC1RQ01726 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MC1RQ01726 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
MC1RQ01726 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
MC1RQ01726 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MC1RQ01726 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MC1RQ01726 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
MC1RQ01726 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MC1RQ01726 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MC1RQ01726 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MC1RQ01726 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MC1RQ01726 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MC1RQ01726 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MC1RQ01726 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MC1RQ01726 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
MC1RQ01726 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MC1RQ01726 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
MC1RQ01726 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
MC1RQ01726 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
MC1RQ01726 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MC1RQ01726 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MC1RQ01726 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MC1RQ01726 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
MC1RQ01726 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MC1RQ01726 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
MC1RQ01726 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MC1RQ01726 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
MC1RQ01726 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
MC1RQ01726 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
MC1RQ01726 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MC1RQ01726 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
MC1RQ01726 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
MC1RQ01726 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MC1RQ01726 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MC1RQ01726 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MC1RQ01726 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MC1RQ01726 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MC1RQ01726 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MC1RQ01726 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
MC1RQ01726 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MC1RQ01726 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MC1RQ01726 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MC1RQ01726 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.3 ms