Protein–RNA interactions for Protein: Q01518

CAP1, Adenylyl cyclase-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAP1Q01518 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CAP1Q01518 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CAP1Q01518 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CAP1Q01518 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CAP1Q01518 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CAP1Q01518 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CAP1Q01518 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CAP1Q01518 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CAP1Q01518 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CAP1Q01518 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAP1Q01518 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAP1Q01518 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAP1Q01518 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAP1Q01518 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAP1Q01518 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAP1Q01518 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAP1Q01518 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAP1Q01518 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAP1Q01518 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAP1Q01518 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAP1Q01518 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAP1Q01518 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAP1Q01518 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAP1Q01518 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAP1Q01518 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAP1Q01518 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAP1Q01518 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAP1Q01518 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAP1Q01518 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAP1Q01518 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAP1Q01518 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CAP1Q01518 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAP1Q01518 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAP1Q01518 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAP1Q01518 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAP1Q01518 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CAP1Q01518 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CAP1Q01518 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAP1Q01518 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CAP1Q01518 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAP1Q01518 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAP1Q01518 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAP1Q01518 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAP1Q01518 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAP1Q01518 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAP1Q01518 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAP1Q01518 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAP1Q01518 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAP1Q01518 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CAP1Q01518 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAP1Q01518 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAP1Q01518 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CAP1Q01518 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAP1Q01518 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAP1Q01518 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAP1Q01518 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAP1Q01518 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CAP1Q01518 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAP1Q01518 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAP1Q01518 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAP1Q01518 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAP1Q01518 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAP1Q01518 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAP1Q01518 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAP1Q01518 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CAP1Q01518 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAP1Q01518 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAP1Q01518 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAP1Q01518 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAP1Q01518 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAP1Q01518 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CAP1Q01518 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CAP1Q01518 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAP1Q01518 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CAP1Q01518 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAP1Q01518 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAP1Q01518 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAP1Q01518 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAP1Q01518 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAP1Q01518 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAP1Q01518 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAP1Q01518 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAP1Q01518 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAP1Q01518 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAP1Q01518 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CAP1Q01518 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CAP1Q01518 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CAP1Q01518 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CAP1Q01518 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CAP1Q01518 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CAP1Q01518 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CAP1Q01518 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CAP1Q01518 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CAP1Q01518 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CAP1Q01518 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CAP1Q01518 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CAP1Q01518 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CAP1Q01518 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CAP1Q01518 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CAP1Q01518 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms