Protein–RNA interactions for Protein: Q00526

CDK3, Cyclin-dependent kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK3Q00526 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CDK3Q00526 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CDK3Q00526 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CDK3Q00526 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
CDK3Q00526 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CDK3Q00526 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
CDK3Q00526 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
CDK3Q00526 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CDK3Q00526 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
CDK3Q00526 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CDK3Q00526 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CDK3Q00526 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CDK3Q00526 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CDK3Q00526 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CDK3Q00526 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CDK3Q00526 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CDK3Q00526 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CDK3Q00526 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CDK3Q00526 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CDK3Q00526 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CDK3Q00526 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
CDK3Q00526 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CDK3Q00526 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
CDK3Q00526 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CDK3Q00526 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CDK3Q00526 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CDK3Q00526 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CDK3Q00526 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CDK3Q00526 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CDK3Q00526 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CDK3Q00526 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CDK3Q00526 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CDK3Q00526 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CDK3Q00526 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CDK3Q00526 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CDK3Q00526 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CDK3Q00526 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CDK3Q00526 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CDK3Q00526 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CDK3Q00526 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CDK3Q00526 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CDK3Q00526 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CDK3Q00526 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CDK3Q00526 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CDK3Q00526 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CDK3Q00526 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
CDK3Q00526 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
CDK3Q00526 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CDK3Q00526 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CDK3Q00526 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CDK3Q00526 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CDK3Q00526 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CDK3Q00526 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CDK3Q00526 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CDK3Q00526 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CDK3Q00526 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CDK3Q00526 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CDK3Q00526 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CDK3Q00526 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CDK3Q00526 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CDK3Q00526 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CDK3Q00526 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CDK3Q00526 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CDK3Q00526 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
CDK3Q00526 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CDK3Q00526 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CDK3Q00526 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CDK3Q00526 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CDK3Q00526 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CDK3Q00526 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CDK3Q00526 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CDK3Q00526 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CDK3Q00526 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CDK3Q00526 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CDK3Q00526 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CDK3Q00526 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CDK3Q00526 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CDK3Q00526 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CDK3Q00526 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CDK3Q00526 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CDK3Q00526 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CDK3Q00526 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CDK3Q00526 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CDK3Q00526 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CDK3Q00526 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CDK3Q00526 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CDK3Q00526 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CDK3Q00526 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CDK3Q00526 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CDK3Q00526 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CDK3Q00526 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CDK3Q00526 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CDK3Q00526 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CDK3Q00526 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CDK3Q00526 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CDK3Q00526 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CDK3Q00526 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CDK3Q00526 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CDK3Q00526 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CDK3Q00526 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms