Protein–RNA interactions for Protein: P82279

CRB1, Protein crumbs homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRB1P82279 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CRB1P82279 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CRB1P82279 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CRB1P82279 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CRB1P82279 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
CRB1P82279 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CRB1P82279 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CRB1P82279 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CRB1P82279 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CRB1P82279 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CRB1P82279 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CRB1P82279 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CRB1P82279 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
CRB1P82279 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
CRB1P82279 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
CRB1P82279 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CRB1P82279 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
CRB1P82279 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CRB1P82279 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CRB1P82279 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
CRB1P82279 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CRB1P82279 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CRB1P82279 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CRB1P82279 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CRB1P82279 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CRB1P82279 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CRB1P82279 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CRB1P82279 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
CRB1P82279 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
CRB1P82279 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CRB1P82279 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CRB1P82279 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
CRB1P82279 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CRB1P82279 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CRB1P82279 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CRB1P82279 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CRB1P82279 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CRB1P82279 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CRB1P82279 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CRB1P82279 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CRB1P82279 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CRB1P82279 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CRB1P82279 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CRB1P82279 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CRB1P82279 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CRB1P82279 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CRB1P82279 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CRB1P82279 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CRB1P82279 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CRB1P82279 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CRB1P82279 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CRB1P82279 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
CRB1P82279 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CRB1P82279 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
CRB1P82279 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CRB1P82279 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
CRB1P82279 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CRB1P82279 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CRB1P82279 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CRB1P82279 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CRB1P82279 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CRB1P82279 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CRB1P82279 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CRB1P82279 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CRB1P82279 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CRB1P82279 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CRB1P82279 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CRB1P82279 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CRB1P82279 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CRB1P82279 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CRB1P82279 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CRB1P82279 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CRB1P82279 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CRB1P82279 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
CRB1P82279 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
CRB1P82279 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CRB1P82279 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CRB1P82279 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CRB1P82279 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CRB1P82279 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CRB1P82279 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CRB1P82279 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CRB1P82279 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CRB1P82279 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CRB1P82279 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CRB1P82279 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CRB1P82279 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CRB1P82279 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CRB1P82279 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CRB1P82279 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CRB1P82279 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CRB1P82279 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
CRB1P82279 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CRB1P82279 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CRB1P82279 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CRB1P82279 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CRB1P82279 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CRB1P82279 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
CRB1P82279 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
CRB1P82279 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms