Protein–RNA interactions for Protein: P82094

TMF1, TATA element modulatory factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMF1P82094 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TMF1P82094 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TMF1P82094 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TMF1P82094 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TMF1P82094 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TMF1P82094 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TMF1P82094 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TMF1P82094 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TMF1P82094 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TMF1P82094 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TMF1P82094 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TMF1P82094 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TMF1P82094 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TMF1P82094 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TMF1P82094 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TMF1P82094 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
TMF1P82094 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TMF1P82094 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TMF1P82094 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TMF1P82094 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TMF1P82094 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TMF1P82094 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TMF1P82094 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TMF1P82094 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TMF1P82094 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TMF1P82094 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TMF1P82094 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TMF1P82094 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TMF1P82094 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TMF1P82094 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
TMF1P82094 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
TMF1P82094 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TMF1P82094 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
TMF1P82094 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TMF1P82094 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TMF1P82094 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
TMF1P82094 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
TMF1P82094 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TMF1P82094 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TMF1P82094 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TMF1P82094 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TMF1P82094 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TMF1P82094 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TMF1P82094 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TMF1P82094 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TMF1P82094 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TMF1P82094 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TMF1P82094 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TMF1P82094 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TMF1P82094 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TMF1P82094 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TMF1P82094 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TMF1P82094 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TMF1P82094 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TMF1P82094 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TMF1P82094 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TMF1P82094 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TMF1P82094 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TMF1P82094 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TMF1P82094 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TMF1P82094 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TMF1P82094 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TMF1P82094 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TMF1P82094 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
TMF1P82094 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TMF1P82094 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TMF1P82094 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TMF1P82094 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TMF1P82094 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TMF1P82094 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TMF1P82094 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TMF1P82094 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TMF1P82094 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TMF1P82094 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TMF1P82094 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TMF1P82094 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TMF1P82094 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TMF1P82094 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TMF1P82094 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TMF1P82094 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TMF1P82094 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TMF1P82094 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TMF1P82094 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TMF1P82094 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TMF1P82094 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TMF1P82094 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TMF1P82094 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TMF1P82094 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
TMF1P82094 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TMF1P82094 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TMF1P82094 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TMF1P82094 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TMF1P82094 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TMF1P82094 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TMF1P82094 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TMF1P82094 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TMF1P82094 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.92
TMF1P82094 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.92
TMF1P82094 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TMF1P82094 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms