Protein–RNA interactions for Protein: P52294

KPNA1, Importin subunit alpha-5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KPNA1P52294 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KPNA1P52294 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KPNA1P52294 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
KPNA1P52294 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KPNA1P52294 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KPNA1P52294 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KPNA1P52294 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KPNA1P52294 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KPNA1P52294 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KPNA1P52294 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KPNA1P52294 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KPNA1P52294 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KPNA1P52294 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KPNA1P52294 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KPNA1P52294 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KPNA1P52294 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KPNA1P52294 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KPNA1P52294 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KPNA1P52294 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KPNA1P52294 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KPNA1P52294 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KPNA1P52294 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KPNA1P52294 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KPNA1P52294 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KPNA1P52294 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KPNA1P52294 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KPNA1P52294 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
KPNA1P52294 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KPNA1P52294 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KPNA1P52294 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
KPNA1P52294 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
KPNA1P52294 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KPNA1P52294 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KPNA1P52294 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
KPNA1P52294 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KPNA1P52294 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KPNA1P52294 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KPNA1P52294 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KPNA1P52294 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KPNA1P52294 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KPNA1P52294 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KPNA1P52294 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KPNA1P52294 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KPNA1P52294 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KPNA1P52294 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KPNA1P52294 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
KPNA1P52294 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KPNA1P52294 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KPNA1P52294 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KPNA1P52294 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KPNA1P52294 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KPNA1P52294 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KPNA1P52294 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KPNA1P52294 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
KPNA1P52294 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KPNA1P52294 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
KPNA1P52294 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
KPNA1P52294 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KPNA1P52294 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KPNA1P52294 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KPNA1P52294 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KPNA1P52294 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KPNA1P52294 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KPNA1P52294 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KPNA1P52294 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KPNA1P52294 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KPNA1P52294 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KPNA1P52294 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
KPNA1P52294 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KPNA1P52294 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KPNA1P52294 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
KPNA1P52294 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KPNA1P52294 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KPNA1P52294 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KPNA1P52294 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KPNA1P52294 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KPNA1P52294 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KPNA1P52294 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KPNA1P52294 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KPNA1P52294 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
KPNA1P52294 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KPNA1P52294 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KPNA1P52294 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KPNA1P52294 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KPNA1P52294 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KPNA1P52294 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KPNA1P52294 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KPNA1P52294 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KPNA1P52294 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KPNA1P52294 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KPNA1P52294 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KPNA1P52294 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KPNA1P52294 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KPNA1P52294 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
KPNA1P52294 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
KPNA1P52294 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
KPNA1P52294 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
KPNA1P52294 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
KPNA1P52294 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
KPNA1P52294 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms