Protein–RNA interactions for Protein: P51965

UBE2E1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E1, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E1P51965 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBE2E1P51965 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBE2E1P51965 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBE2E1P51965 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBE2E1P51965 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBE2E1P51965 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBE2E1P51965 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBE2E1P51965 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBE2E1P51965 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBE2E1P51965 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBE2E1P51965 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
UBE2E1P51965 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBE2E1P51965 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBE2E1P51965 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBE2E1P51965 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBE2E1P51965 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBE2E1P51965 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBE2E1P51965 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBE2E1P51965 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBE2E1P51965 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBE2E1P51965 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBE2E1P51965 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBE2E1P51965 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBE2E1P51965 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
UBE2E1P51965 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBE2E1P51965 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBE2E1P51965 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBE2E1P51965 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.13
UBE2E1P51965 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
UBE2E1P51965 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.13
UBE2E1P51965 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
UBE2E1P51965 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
UBE2E1P51965 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
UBE2E1P51965 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
UBE2E1P51965 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
UBE2E1P51965 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
UBE2E1P51965 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
UBE2E1P51965 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
UBE2E1P51965 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
UBE2E1P51965 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
UBE2E1P51965 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
UBE2E1P51965 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
UBE2E1P51965 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
UBE2E1P51965 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
UBE2E1P51965 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
UBE2E1P51965 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
UBE2E1P51965 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
UBE2E1P51965 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
UBE2E1P51965 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
UBE2E1P51965 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
UBE2E1P51965 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
UBE2E1P51965 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
UBE2E1P51965 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
UBE2E1P51965 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
UBE2E1P51965 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
UBE2E1P51965 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
UBE2E1P51965 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
UBE2E1P51965 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
UBE2E1P51965 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
UBE2E1P51965 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
UBE2E1P51965 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
UBE2E1P51965 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
UBE2E1P51965 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
UBE2E1P51965 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
UBE2E1P51965 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
UBE2E1P51965 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
UBE2E1P51965 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
UBE2E1P51965 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
UBE2E1P51965 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
UBE2E1P51965 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
UBE2E1P51965 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
UBE2E1P51965 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
UBE2E1P51965 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
UBE2E1P51965 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
UBE2E1P51965 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
UBE2E1P51965 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
UBE2E1P51965 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
UBE2E1P51965 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
UBE2E1P51965 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
UBE2E1P51965 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
UBE2E1P51965 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
UBE2E1P51965 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
UBE2E1P51965 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
UBE2E1P51965 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
UBE2E1P51965 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
UBE2E1P51965 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
UBE2E1P51965 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
UBE2E1P51965 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
UBE2E1P51965 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
UBE2E1P51965 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
UBE2E1P51965 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
UBE2E1P51965 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
UBE2E1P51965 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
UBE2E1P51965 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
UBE2E1P51965 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
UBE2E1P51965 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
UBE2E1P51965 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
UBE2E1P51965 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
UBE2E1P51965 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
UBE2E1P51965 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms