Protein–RNA interactions for Protein: P49418

AMPH, Amphiphysin, humanhuman

Predictions only

Length 695 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMPHP49418 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
AMPHP49418 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
AMPHP49418 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
AMPHP49418 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
AMPHP49418 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
AMPHP49418 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
AMPHP49418 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
AMPHP49418 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
AMPHP49418 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
AMPHP49418 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
AMPHP49418 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
AMPHP49418 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
AMPHP49418 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
AMPHP49418 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
AMPHP49418 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
AMPHP49418 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.12■■□□□ 1.77
AMPHP49418 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
AMPHP49418 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
AMPHP49418 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
AMPHP49418 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
AMPHP49418 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
AMPHP49418 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
AMPHP49418 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
AMPHP49418 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
AMPHP49418 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
AMPHP49418 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
AMPHP49418 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
AMPHP49418 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
AMPHP49418 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
AMPHP49418 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
AMPHP49418 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
AMPHP49418 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
AMPHP49418 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
AMPHP49418 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
AMPHP49418 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
AMPHP49418 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
AMPHP49418 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
AMPHP49418 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
AMPHP49418 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
AMPHP49418 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
AMPHP49418 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
AMPHP49418 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
AMPHP49418 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
AMPHP49418 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
AMPHP49418 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
AMPHP49418 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
AMPHP49418 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC26.1■■□□□ 1.77
AMPHP49418 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
AMPHP49418 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
AMPHP49418 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
AMPHP49418 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
AMPHP49418 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
AMPHP49418 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
AMPHP49418 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
AMPHP49418 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
AMPHP49418 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
AMPHP49418 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
AMPHP49418 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
AMPHP49418 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
AMPHP49418 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
AMPHP49418 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
AMPHP49418 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
AMPHP49418 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
AMPHP49418 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
AMPHP49418 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
AMPHP49418 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
AMPHP49418 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
AMPHP49418 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
AMPHP49418 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
AMPHP49418 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
AMPHP49418 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
AMPHP49418 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
AMPHP49418 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
AMPHP49418 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
AMPHP49418 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
AMPHP49418 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
AMPHP49418 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
AMPHP49418 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
AMPHP49418 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
AMPHP49418 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
AMPHP49418 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
AMPHP49418 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
AMPHP49418 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
AMPHP49418 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
AMPHP49418 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
AMPHP49418 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
AMPHP49418 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
AMPHP49418 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
AMPHP49418 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
AMPHP49418 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
AMPHP49418 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
AMPHP49418 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
AMPHP49418 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
AMPHP49418 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
AMPHP49418 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
AMPHP49418 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
AMPHP49418 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
AMPHP49418 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
AMPHP49418 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
AMPHP49418 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms