Protein–RNA interactions for Protein: P47756

CAPZB, F-actin-capping protein subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 277 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPZBP47756 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CAPZBP47756 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CAPZBP47756 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CAPZBP47756 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CAPZBP47756 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CAPZBP47756 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CAPZBP47756 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CAPZBP47756 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CAPZBP47756 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CAPZBP47756 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CAPZBP47756 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CAPZBP47756 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CAPZBP47756 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CAPZBP47756 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CAPZBP47756 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CAPZBP47756 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CAPZBP47756 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CAPZBP47756 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CAPZBP47756 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CAPZBP47756 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CAPZBP47756 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CAPZBP47756 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CAPZBP47756 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CAPZBP47756 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CAPZBP47756 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CAPZBP47756 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CAPZBP47756 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CAPZBP47756 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CAPZBP47756 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CAPZBP47756 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CAPZBP47756 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CAPZBP47756 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CAPZBP47756 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CAPZBP47756 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CAPZBP47756 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CAPZBP47756 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CAPZBP47756 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CAPZBP47756 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CAPZBP47756 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CAPZBP47756 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CAPZBP47756 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CAPZBP47756 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CAPZBP47756 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CAPZBP47756 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CAPZBP47756 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CAPZBP47756 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CAPZBP47756 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CAPZBP47756 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CAPZBP47756 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CAPZBP47756 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CAPZBP47756 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CAPZBP47756 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CAPZBP47756 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CAPZBP47756 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CAPZBP47756 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CAPZBP47756 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CAPZBP47756 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CAPZBP47756 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CAPZBP47756 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CAPZBP47756 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CAPZBP47756 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CAPZBP47756 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CAPZBP47756 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CAPZBP47756 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CAPZBP47756 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CAPZBP47756 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CAPZBP47756 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CAPZBP47756 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CAPZBP47756 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CAPZBP47756 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CAPZBP47756 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CAPZBP47756 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CAPZBP47756 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CAPZBP47756 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CAPZBP47756 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CAPZBP47756 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CAPZBP47756 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CAPZBP47756 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CAPZBP47756 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CAPZBP47756 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CAPZBP47756 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CAPZBP47756 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CAPZBP47756 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CAPZBP47756 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CAPZBP47756 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CAPZBP47756 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CAPZBP47756 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CAPZBP47756 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CAPZBP47756 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CAPZBP47756 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CAPZBP47756 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CAPZBP47756 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CAPZBP47756 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CAPZBP47756 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CAPZBP47756 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CAPZBP47756 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CAPZBP47756 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CAPZBP47756 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CAPZBP47756 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CAPZBP47756 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms