Protein–RNA interactions for Protein: P47211

GALR1, Galanin receptor type 1, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GALR1P47211 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GALR1P47211 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GALR1P47211 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GALR1P47211 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GALR1P47211 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GALR1P47211 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GALR1P47211 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GALR1P47211 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GALR1P47211 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GALR1P47211 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GALR1P47211 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GALR1P47211 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GALR1P47211 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GALR1P47211 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GALR1P47211 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GALR1P47211 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GALR1P47211 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GALR1P47211 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GALR1P47211 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GALR1P47211 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GALR1P47211 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GALR1P47211 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GALR1P47211 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GALR1P47211 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GALR1P47211 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GALR1P47211 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GALR1P47211 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GALR1P47211 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GALR1P47211 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GALR1P47211 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GALR1P47211 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GALR1P47211 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GALR1P47211 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GALR1P47211 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GALR1P47211 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GALR1P47211 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GALR1P47211 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GALR1P47211 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GALR1P47211 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GALR1P47211 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GALR1P47211 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GALR1P47211 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GALR1P47211 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GALR1P47211 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GALR1P47211 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GALR1P47211 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GALR1P47211 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GALR1P47211 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GALR1P47211 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GALR1P47211 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GALR1P47211 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GALR1P47211 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GALR1P47211 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GALR1P47211 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GALR1P47211 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GALR1P47211 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GALR1P47211 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GALR1P47211 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GALR1P47211 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GALR1P47211 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GALR1P47211 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GALR1P47211 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GALR1P47211 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GALR1P47211 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GALR1P47211 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GALR1P47211 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GALR1P47211 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GALR1P47211 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GALR1P47211 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GALR1P47211 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GALR1P47211 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GALR1P47211 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GALR1P47211 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GALR1P47211 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GALR1P47211 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GALR1P47211 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GALR1P47211 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GALR1P47211 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GALR1P47211 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GALR1P47211 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GALR1P47211 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GALR1P47211 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GALR1P47211 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GALR1P47211 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GALR1P47211 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GALR1P47211 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GALR1P47211 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GALR1P47211 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GALR1P47211 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GALR1P47211 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GALR1P47211 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GALR1P47211 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GALR1P47211 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GALR1P47211 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GALR1P47211 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GALR1P47211 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GALR1P47211 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GALR1P47211 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GALR1P47211 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GALR1P47211 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms