Protein–RNA interactions for Protein: P36406

TRIM23, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM23, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM23P36406 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRIM23P36406 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRIM23P36406 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRIM23P36406 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
TRIM23P36406 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRIM23P36406 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRIM23P36406 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRIM23P36406 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRIM23P36406 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRIM23P36406 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRIM23P36406 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRIM23P36406 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRIM23P36406 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRIM23P36406 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRIM23P36406 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRIM23P36406 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRIM23P36406 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRIM23P36406 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
TRIM23P36406 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRIM23P36406 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRIM23P36406 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRIM23P36406 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRIM23P36406 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRIM23P36406 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRIM23P36406 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRIM23P36406 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRIM23P36406 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
TRIM23P36406 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
TRIM23P36406 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
TRIM23P36406 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
TRIM23P36406 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRIM23P36406 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRIM23P36406 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRIM23P36406 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRIM23P36406 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRIM23P36406 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRIM23P36406 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
TRIM23P36406 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRIM23P36406 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRIM23P36406 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRIM23P36406 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRIM23P36406 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRIM23P36406 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRIM23P36406 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRIM23P36406 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRIM23P36406 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRIM23P36406 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRIM23P36406 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRIM23P36406 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRIM23P36406 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRIM23P36406 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
TRIM23P36406 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRIM23P36406 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRIM23P36406 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRIM23P36406 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRIM23P36406 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRIM23P36406 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRIM23P36406 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRIM23P36406 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRIM23P36406 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRIM23P36406 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRIM23P36406 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRIM23P36406 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRIM23P36406 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
TRIM23P36406 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
TRIM23P36406 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRIM23P36406 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRIM23P36406 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
TRIM23P36406 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRIM23P36406 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRIM23P36406 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRIM23P36406 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRIM23P36406 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRIM23P36406 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRIM23P36406 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRIM23P36406 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRIM23P36406 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRIM23P36406 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRIM23P36406 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRIM23P36406 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRIM23P36406 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRIM23P36406 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRIM23P36406 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRIM23P36406 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRIM23P36406 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRIM23P36406 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRIM23P36406 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRIM23P36406 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRIM23P36406 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRIM23P36406 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRIM23P36406 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
TRIM23P36406 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
TRIM23P36406 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
TRIM23P36406 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRIM23P36406 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRIM23P36406 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRIM23P36406 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRIM23P36406 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRIM23P36406 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRIM23P36406 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms