Protein–RNA interactions for Protein: P36405

ARL3, ADP-ribosylation factor-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL3P36405 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARL3P36405 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARL3P36405 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARL3P36405 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARL3P36405 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARL3P36405 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARL3P36405 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARL3P36405 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARL3P36405 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARL3P36405 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARL3P36405 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARL3P36405 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARL3P36405 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARL3P36405 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARL3P36405 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARL3P36405 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARL3P36405 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARL3P36405 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARL3P36405 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARL3P36405 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARL3P36405 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARL3P36405 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARL3P36405 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARL3P36405 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARL3P36405 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARL3P36405 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARL3P36405 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARL3P36405 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARL3P36405 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARL3P36405 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ARL3P36405 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARL3P36405 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARL3P36405 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARL3P36405 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARL3P36405 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARL3P36405 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARL3P36405 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARL3P36405 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARL3P36405 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARL3P36405 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARL3P36405 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARL3P36405 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARL3P36405 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARL3P36405 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARL3P36405 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARL3P36405 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARL3P36405 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARL3P36405 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARL3P36405 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARL3P36405 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ARL3P36405 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARL3P36405 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARL3P36405 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARL3P36405 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ARL3P36405 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARL3P36405 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARL3P36405 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARL3P36405 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARL3P36405 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARL3P36405 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARL3P36405 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARL3P36405 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARL3P36405 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARL3P36405 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ARL3P36405 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARL3P36405 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARL3P36405 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARL3P36405 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ARL3P36405 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ARL3P36405 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARL3P36405 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARL3P36405 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARL3P36405 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARL3P36405 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARL3P36405 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARL3P36405 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARL3P36405 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARL3P36405 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARL3P36405 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARL3P36405 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARL3P36405 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARL3P36405 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARL3P36405 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARL3P36405 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARL3P36405 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARL3P36405 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARL3P36405 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARL3P36405 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARL3P36405 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARL3P36405 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARL3P36405 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARL3P36405 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARL3P36405 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARL3P36405 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ARL3P36405 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARL3P36405 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARL3P36405 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARL3P36405 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARL3P36405 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARL3P36405 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms