Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

Predictions only

Length 1,452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PTPRMP28827 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PTPRMP28827 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PTPRMP28827 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PTPRMP28827 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PTPRMP28827 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PTPRMP28827 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PTPRMP28827 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PTPRMP28827 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PTPRMP28827 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PTPRMP28827 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PTPRMP28827 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PTPRMP28827 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PTPRMP28827 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PTPRMP28827 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PTPRMP28827 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PTPRMP28827 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PTPRMP28827 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PTPRMP28827 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PTPRMP28827 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PTPRMP28827 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PTPRMP28827 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
PTPRMP28827 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PTPRMP28827 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
PTPRMP28827 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PTPRMP28827 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
PTPRMP28827 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
PTPRMP28827 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PTPRMP28827 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PTPRMP28827 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PTPRMP28827 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PTPRMP28827 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PTPRMP28827 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PTPRMP28827 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PTPRMP28827 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PTPRMP28827 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PTPRMP28827 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PTPRMP28827 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PTPRMP28827 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PTPRMP28827 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PTPRMP28827 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PTPRMP28827 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PTPRMP28827 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PTPRMP28827 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PTPRMP28827 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PTPRMP28827 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PTPRMP28827 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
PTPRMP28827 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
PTPRMP28827 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.2
PTPRMP28827 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.2
PTPRMP28827 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
PTPRMP28827 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PTPRMP28827 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PTPRMP28827 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PTPRMP28827 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PTPRMP28827 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PTPRMP28827 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PTPRMP28827 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PTPRMP28827 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PTPRMP28827 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
PTPRMP28827 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PTPRMP28827 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PTPRMP28827 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PTPRMP28827 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PTPRMP28827 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
PTPRMP28827 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PTPRMP28827 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PTPRMP28827 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PTPRMP28827 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PTPRMP28827 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PTPRMP28827 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PTPRMP28827 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PTPRMP28827 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PTPRMP28827 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PTPRMP28827 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
PTPRMP28827 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PTPRMP28827 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PTPRMP28827 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PTPRMP28827 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PTPRMP28827 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PTPRMP28827 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PTPRMP28827 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PTPRMP28827 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PTPRMP28827 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PTPRMP28827 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PTPRMP28827 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PTPRMP28827 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PTPRMP28827 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PTPRMP28827 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PTPRMP28827 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PTPRMP28827 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
PTPRMP28827 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PTPRMP28827 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PTPRMP28827 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PTPRMP28827 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PTPRMP28827 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PTPRMP28827 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PTPRMP28827 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PTPRMP28827 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PTPRMP28827 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms