Protein–RNA interactions for Protein: P26006

ITGA3, Integrin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3P26006 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ITGA3P26006 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ITGA3P26006 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ITGA3P26006 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ITGA3P26006 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ITGA3P26006 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ITGA3P26006 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ITGA3P26006 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ITGA3P26006 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ITGA3P26006 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ITGA3P26006 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ITGA3P26006 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ITGA3P26006 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ITGA3P26006 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ITGA3P26006 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ITGA3P26006 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ITGA3P26006 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ITGA3P26006 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
ITGA3P26006 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ITGA3P26006 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ITGA3P26006 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ITGA3P26006 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ITGA3P26006 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ITGA3P26006 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ITGA3P26006 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ITGA3P26006 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ITGA3P26006 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ITGA3P26006 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ITGA3P26006 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ITGA3P26006 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ITGA3P26006 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ITGA3P26006 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ITGA3P26006 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ITGA3P26006 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ITGA3P26006 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ITGA3P26006 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ITGA3P26006 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ITGA3P26006 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ITGA3P26006 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ITGA3P26006 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ITGA3P26006 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ITGA3P26006 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ITGA3P26006 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ITGA3P26006 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ITGA3P26006 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ITGA3P26006 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ITGA3P26006 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ITGA3P26006 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ITGA3P26006 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ITGA3P26006 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ITGA3P26006 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ITGA3P26006 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ITGA3P26006 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ITGA3P26006 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ITGA3P26006 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ITGA3P26006 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ITGA3P26006 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ITGA3P26006 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ITGA3P26006 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ITGA3P26006 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ITGA3P26006 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ITGA3P26006 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ITGA3P26006 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ITGA3P26006 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ITGA3P26006 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ITGA3P26006 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ITGA3P26006 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ITGA3P26006 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ITGA3P26006 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ITGA3P26006 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ITGA3P26006 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ITGA3P26006 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ITGA3P26006 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ITGA3P26006 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ITGA3P26006 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ITGA3P26006 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ITGA3P26006 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ITGA3P26006 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ITGA3P26006 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ITGA3P26006 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ITGA3P26006 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ITGA3P26006 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ITGA3P26006 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ITGA3P26006 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ITGA3P26006 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ITGA3P26006 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ITGA3P26006 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ITGA3P26006 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ITGA3P26006 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ITGA3P26006 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ITGA3P26006 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ITGA3P26006 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ITGA3P26006 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ITGA3P26006 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ITGA3P26006 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ITGA3P26006 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ITGA3P26006 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ITGA3P26006 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ITGA3P26006 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ITGA3P26006 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms