Protein–RNA interactions for Protein: P23510

TNFSF4, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 4, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF4P23510 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TNFSF4P23510 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TNFSF4P23510 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TNFSF4P23510 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TNFSF4P23510 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TNFSF4P23510 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TNFSF4P23510 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TNFSF4P23510 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TNFSF4P23510 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TNFSF4P23510 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TNFSF4P23510 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TNFSF4P23510 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TNFSF4P23510 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TNFSF4P23510 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TNFSF4P23510 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TNFSF4P23510 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TNFSF4P23510 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TNFSF4P23510 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TNFSF4P23510 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TNFSF4P23510 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TNFSF4P23510 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TNFSF4P23510 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TNFSF4P23510 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TNFSF4P23510 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TNFSF4P23510 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TNFSF4P23510 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TNFSF4P23510 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TNFSF4P23510 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TNFSF4P23510 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TNFSF4P23510 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TNFSF4P23510 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TNFSF4P23510 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TNFSF4P23510 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TNFSF4P23510 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TNFSF4P23510 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TNFSF4P23510 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TNFSF4P23510 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TNFSF4P23510 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TNFSF4P23510 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TNFSF4P23510 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TNFSF4P23510 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TNFSF4P23510 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TNFSF4P23510 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TNFSF4P23510 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TNFSF4P23510 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TNFSF4P23510 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TNFSF4P23510 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TNFSF4P23510 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TNFSF4P23510 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TNFSF4P23510 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TNFSF4P23510 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TNFSF4P23510 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TNFSF4P23510 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TNFSF4P23510 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TNFSF4P23510 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TNFSF4P23510 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TNFSF4P23510 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TNFSF4P23510 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TNFSF4P23510 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TNFSF4P23510 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TNFSF4P23510 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TNFSF4P23510 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TNFSF4P23510 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TNFSF4P23510 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TNFSF4P23510 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TNFSF4P23510 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TNFSF4P23510 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TNFSF4P23510 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TNFSF4P23510 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TNFSF4P23510 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TNFSF4P23510 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TNFSF4P23510 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TNFSF4P23510 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TNFSF4P23510 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TNFSF4P23510 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TNFSF4P23510 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TNFSF4P23510 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TNFSF4P23510 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TNFSF4P23510 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TNFSF4P23510 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TNFSF4P23510 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TNFSF4P23510 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TNFSF4P23510 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TNFSF4P23510 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TNFSF4P23510 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TNFSF4P23510 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TNFSF4P23510 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TNFSF4P23510 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TNFSF4P23510 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TNFSF4P23510 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TNFSF4P23510 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TNFSF4P23510 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TNFSF4P23510 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TNFSF4P23510 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TNFSF4P23510 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TNFSF4P23510 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TNFSF4P23510 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TNFSF4P23510 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TNFSF4P23510 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TNFSF4P23510 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms