Protein–RNA interactions for Protein: P20827

EFNA1, Ephrin-A1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA1P20827 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
EFNA1P20827 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
EFNA1P20827 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
EFNA1P20827 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
EFNA1P20827 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
EFNA1P20827 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
EFNA1P20827 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
EFNA1P20827 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
EFNA1P20827 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
EFNA1P20827 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
EFNA1P20827 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
EFNA1P20827 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
EFNA1P20827 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
EFNA1P20827 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
EFNA1P20827 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
EFNA1P20827 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
EFNA1P20827 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
EFNA1P20827 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
EFNA1P20827 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
EFNA1P20827 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
EFNA1P20827 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
EFNA1P20827 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
EFNA1P20827 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
EFNA1P20827 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
EFNA1P20827 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
EFNA1P20827 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
EFNA1P20827 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
EFNA1P20827 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
EFNA1P20827 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
EFNA1P20827 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
EFNA1P20827 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
EFNA1P20827 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
EFNA1P20827 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
EFNA1P20827 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
EFNA1P20827 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
EFNA1P20827 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
EFNA1P20827 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
EFNA1P20827 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
EFNA1P20827 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
EFNA1P20827 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
EFNA1P20827 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
EFNA1P20827 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
EFNA1P20827 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
EFNA1P20827 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
EFNA1P20827 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
EFNA1P20827 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
EFNA1P20827 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
EFNA1P20827 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
EFNA1P20827 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
EFNA1P20827 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
EFNA1P20827 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
EFNA1P20827 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
EFNA1P20827 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
EFNA1P20827 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
EFNA1P20827 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
EFNA1P20827 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
EFNA1P20827 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
EFNA1P20827 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
EFNA1P20827 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
EFNA1P20827 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
EFNA1P20827 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
EFNA1P20827 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
EFNA1P20827 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
EFNA1P20827 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
EFNA1P20827 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
EFNA1P20827 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
EFNA1P20827 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
EFNA1P20827 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
EFNA1P20827 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
EFNA1P20827 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
EFNA1P20827 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
EFNA1P20827 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
EFNA1P20827 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
EFNA1P20827 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
EFNA1P20827 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
EFNA1P20827 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
EFNA1P20827 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
EFNA1P20827 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
EFNA1P20827 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
EFNA1P20827 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
EFNA1P20827 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
EFNA1P20827 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
EFNA1P20827 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
EFNA1P20827 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
EFNA1P20827 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
EFNA1P20827 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
EFNA1P20827 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
EFNA1P20827 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
EFNA1P20827 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
EFNA1P20827 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
EFNA1P20827 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
EFNA1P20827 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
EFNA1P20827 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
EFNA1P20827 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
EFNA1P20827 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
EFNA1P20827 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
EFNA1P20827 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
EFNA1P20827 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
EFNA1P20827 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
EFNA1P20827 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms