Protein–RNA interactions for Protein: P17482

HOXB9, Homeobox protein Hox-B9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB9P17482 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXB9P17482 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXB9P17482 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXB9P17482 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXB9P17482 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXB9P17482 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXB9P17482 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXB9P17482 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXB9P17482 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXB9P17482 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXB9P17482 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXB9P17482 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXB9P17482 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXB9P17482 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXB9P17482 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXB9P17482 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXB9P17482 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXB9P17482 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXB9P17482 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXB9P17482 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXB9P17482 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXB9P17482 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXB9P17482 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXB9P17482 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXB9P17482 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXB9P17482 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXB9P17482 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXB9P17482 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXB9P17482 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXB9P17482 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXB9P17482 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXB9P17482 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXB9P17482 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXB9P17482 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXB9P17482 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXB9P17482 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXB9P17482 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXB9P17482 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXB9P17482 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXB9P17482 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXB9P17482 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXB9P17482 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXB9P17482 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXB9P17482 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXB9P17482 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXB9P17482 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXB9P17482 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXB9P17482 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXB9P17482 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXB9P17482 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXB9P17482 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXB9P17482 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXB9P17482 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXB9P17482 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXB9P17482 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXB9P17482 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXB9P17482 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXB9P17482 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXB9P17482 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXB9P17482 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXB9P17482 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXB9P17482 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXB9P17482 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXB9P17482 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXB9P17482 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXB9P17482 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXB9P17482 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXB9P17482 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXB9P17482 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXB9P17482 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXB9P17482 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXB9P17482 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXB9P17482 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXB9P17482 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXB9P17482 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXB9P17482 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXB9P17482 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXB9P17482 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXB9P17482 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXB9P17482 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXB9P17482 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXB9P17482 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXB9P17482 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXB9P17482 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXB9P17482 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXB9P17482 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXB9P17482 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXB9P17482 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXB9P17482 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXB9P17482 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXB9P17482 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXB9P17482 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXB9P17482 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXB9P17482 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXB9P17482 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXB9P17482 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXB9P17482 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXB9P17482 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXB9P17482 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXB9P17482 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms