Protein–RNA interactions for Protein: P13521

SCG2, Secretogranin-2, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCG2P13521 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCG2P13521 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCG2P13521 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCG2P13521 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCG2P13521 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCG2P13521 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCG2P13521 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCG2P13521 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCG2P13521 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCG2P13521 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCG2P13521 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCG2P13521 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCG2P13521 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCG2P13521 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCG2P13521 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCG2P13521 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCG2P13521 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SCG2P13521 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCG2P13521 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCG2P13521 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCG2P13521 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCG2P13521 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCG2P13521 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCG2P13521 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCG2P13521 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCG2P13521 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCG2P13521 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
SCG2P13521 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCG2P13521 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCG2P13521 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCG2P13521 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCG2P13521 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCG2P13521 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCG2P13521 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCG2P13521 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCG2P13521 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCG2P13521 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCG2P13521 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCG2P13521 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCG2P13521 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCG2P13521 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCG2P13521 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCG2P13521 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCG2P13521 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCG2P13521 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCG2P13521 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCG2P13521 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCG2P13521 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCG2P13521 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCG2P13521 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCG2P13521 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCG2P13521 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCG2P13521 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCG2P13521 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCG2P13521 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCG2P13521 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCG2P13521 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCG2P13521 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCG2P13521 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCG2P13521 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCG2P13521 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCG2P13521 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCG2P13521 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCG2P13521 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCG2P13521 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCG2P13521 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCG2P13521 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SCG2P13521 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCG2P13521 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCG2P13521 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCG2P13521 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCG2P13521 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCG2P13521 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCG2P13521 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCG2P13521 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCG2P13521 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCG2P13521 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCG2P13521 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCG2P13521 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCG2P13521 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCG2P13521 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCG2P13521 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCG2P13521 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCG2P13521 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCG2P13521 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCG2P13521 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCG2P13521 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCG2P13521 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCG2P13521 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCG2P13521 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCG2P13521 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCG2P13521 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCG2P13521 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCG2P13521 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCG2P13521 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCG2P13521 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCG2P13521 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCG2P13521 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCG2P13521 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCG2P13521 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.5 ms