Protein–RNA interactions for Protein: P0DN86

CGB3, Choriogonadotropin subunit beta 3, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGB3P0DN86 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CGB3P0DN86 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CGB3P0DN86 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CGB3P0DN86 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CGB3P0DN86 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CGB3P0DN86 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CGB3P0DN86 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CGB3P0DN86 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CGB3P0DN86 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CGB3P0DN86 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CGB3P0DN86 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CGB3P0DN86 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CGB3P0DN86 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CGB3P0DN86 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CGB3P0DN86 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CGB3P0DN86 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CGB3P0DN86 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CGB3P0DN86 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CGB3P0DN86 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CGB3P0DN86 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CGB3P0DN86 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CGB3P0DN86 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CGB3P0DN86 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CGB3P0DN86 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CGB3P0DN86 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CGB3P0DN86 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CGB3P0DN86 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CGB3P0DN86 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CGB3P0DN86 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CGB3P0DN86 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CGB3P0DN86 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CGB3P0DN86 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CGB3P0DN86 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CGB3P0DN86 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CGB3P0DN86 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CGB3P0DN86 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CGB3P0DN86 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CGB3P0DN86 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CGB3P0DN86 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CGB3P0DN86 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CGB3P0DN86 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CGB3P0DN86 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CGB3P0DN86 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CGB3P0DN86 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CGB3P0DN86 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CGB3P0DN86 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CGB3P0DN86 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CGB3P0DN86 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CGB3P0DN86 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CGB3P0DN86 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CGB3P0DN86 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CGB3P0DN86 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CGB3P0DN86 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CGB3P0DN86 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CGB3P0DN86 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CGB3P0DN86 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CGB3P0DN86 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CGB3P0DN86 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CGB3P0DN86 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CGB3P0DN86 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CGB3P0DN86 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CGB3P0DN86 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CGB3P0DN86 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CGB3P0DN86 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CGB3P0DN86 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CGB3P0DN86 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CGB3P0DN86 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CGB3P0DN86 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CGB3P0DN86 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CGB3P0DN86 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CGB3P0DN86 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CGB3P0DN86 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CGB3P0DN86 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CGB3P0DN86 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CGB3P0DN86 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CGB3P0DN86 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CGB3P0DN86 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CGB3P0DN86 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CGB3P0DN86 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CGB3P0DN86 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CGB3P0DN86 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CGB3P0DN86 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CGB3P0DN86 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CGB3P0DN86 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CGB3P0DN86 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CGB3P0DN86 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CGB3P0DN86 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CGB3P0DN86 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CGB3P0DN86 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CGB3P0DN86 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CGB3P0DN86 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CGB3P0DN86 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CGB3P0DN86 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CGB3P0DN86 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CGB3P0DN86 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CGB3P0DN86 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CGB3P0DN86 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CGB3P0DN86 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CGB3P0DN86 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CGB3P0DN86 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms