Protein–RNA interactions for Protein: P0DMW4

SMIM10L2A, Small integral membrane protein 10-like protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM10L2AP0DMW4 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMIM10L2AP0DMW4 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMIM10L2AP0DMW4 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMIM10L2AP0DMW4 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMIM10L2AP0DMW4 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMIM10L2AP0DMW4 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMIM10L2AP0DMW4 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMIM10L2AP0DMW4 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMIM10L2AP0DMW4 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMIM10L2AP0DMW4 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SMIM10L2AP0DMW4 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMIM10L2AP0DMW4 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SMIM10L2AP0DMW4 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMIM10L2AP0DMW4 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMIM10L2AP0DMW4 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMIM10L2AP0DMW4 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMIM10L2AP0DMW4 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMIM10L2AP0DMW4 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMIM10L2AP0DMW4 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMIM10L2AP0DMW4 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMIM10L2AP0DMW4 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMIM10L2AP0DMW4 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMIM10L2AP0DMW4 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMIM10L2AP0DMW4 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMIM10L2AP0DMW4 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SMIM10L2AP0DMW4 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMIM10L2AP0DMW4 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SMIM10L2AP0DMW4 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMIM10L2AP0DMW4 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMIM10L2AP0DMW4 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMIM10L2AP0DMW4 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMIM10L2AP0DMW4 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMIM10L2AP0DMW4 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMIM10L2AP0DMW4 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMIM10L2AP0DMW4 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMIM10L2AP0DMW4 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMIM10L2AP0DMW4 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMIM10L2AP0DMW4 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SMIM10L2AP0DMW4 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMIM10L2AP0DMW4 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMIM10L2AP0DMW4 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SMIM10L2AP0DMW4 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMIM10L2AP0DMW4 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMIM10L2AP0DMW4 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMIM10L2AP0DMW4 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMIM10L2AP0DMW4 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMIM10L2AP0DMW4 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMIM10L2AP0DMW4 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMIM10L2AP0DMW4 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMIM10L2AP0DMW4 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMIM10L2AP0DMW4 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMIM10L2AP0DMW4 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMIM10L2AP0DMW4 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMIM10L2AP0DMW4 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMIM10L2AP0DMW4 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMIM10L2AP0DMW4 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMIM10L2AP0DMW4 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMIM10L2AP0DMW4 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMIM10L2AP0DMW4 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMIM10L2AP0DMW4 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMIM10L2AP0DMW4 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMIM10L2AP0DMW4 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMIM10L2AP0DMW4 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMIM10L2AP0DMW4 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMIM10L2AP0DMW4 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SMIM10L2AP0DMW4 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMIM10L2AP0DMW4 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMIM10L2AP0DMW4 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMIM10L2AP0DMW4 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMIM10L2AP0DMW4 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMIM10L2AP0DMW4 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMIM10L2AP0DMW4 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMIM10L2AP0DMW4 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMIM10L2AP0DMW4 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMIM10L2AP0DMW4 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
SMIM10L2AP0DMW4 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SMIM10L2AP0DMW4 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
SMIM10L2AP0DMW4 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
SMIM10L2AP0DMW4 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
SMIM10L2AP0DMW4 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMIM10L2AP0DMW4 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMIM10L2AP0DMW4 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMIM10L2AP0DMW4 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMIM10L2AP0DMW4 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMIM10L2AP0DMW4 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMIM10L2AP0DMW4 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMIM10L2AP0DMW4 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMIM10L2AP0DMW4 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMIM10L2AP0DMW4 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMIM10L2AP0DMW4 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMIM10L2AP0DMW4 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMIM10L2AP0DMW4 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMIM10L2AP0DMW4 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMIM10L2AP0DMW4 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMIM10L2AP0DMW4 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMIM10L2AP0DMW4 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SMIM10L2AP0DMW4 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SMIM10L2AP0DMW4 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMIM10L2AP0DMW4 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMIM10L2AP0DMW4 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms