Protein–RNA interactions for Protein: P0C2W7

CT47B1, Cancer/testis antigen 47B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CT47B1P0C2W7 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CT47B1P0C2W7 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CT47B1P0C2W7 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CT47B1P0C2W7 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CT47B1P0C2W7 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CT47B1P0C2W7 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CT47B1P0C2W7 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CT47B1P0C2W7 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CT47B1P0C2W7 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CT47B1P0C2W7 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CT47B1P0C2W7 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CT47B1P0C2W7 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CT47B1P0C2W7 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CT47B1P0C2W7 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CT47B1P0C2W7 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CT47B1P0C2W7 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CT47B1P0C2W7 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CT47B1P0C2W7 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CT47B1P0C2W7 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CT47B1P0C2W7 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CT47B1P0C2W7 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CT47B1P0C2W7 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CT47B1P0C2W7 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CT47B1P0C2W7 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CT47B1P0C2W7 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CT47B1P0C2W7 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CT47B1P0C2W7 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CT47B1P0C2W7 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CT47B1P0C2W7 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CT47B1P0C2W7 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CT47B1P0C2W7 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CT47B1P0C2W7 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CT47B1P0C2W7 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CT47B1P0C2W7 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CT47B1P0C2W7 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CT47B1P0C2W7 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CT47B1P0C2W7 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CT47B1P0C2W7 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CT47B1P0C2W7 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CT47B1P0C2W7 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CT47B1P0C2W7 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CT47B1P0C2W7 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CT47B1P0C2W7 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CT47B1P0C2W7 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CT47B1P0C2W7 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CT47B1P0C2W7 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CT47B1P0C2W7 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CT47B1P0C2W7 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CT47B1P0C2W7 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CT47B1P0C2W7 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CT47B1P0C2W7 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CT47B1P0C2W7 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CT47B1P0C2W7 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CT47B1P0C2W7 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CT47B1P0C2W7 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CT47B1P0C2W7 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CT47B1P0C2W7 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CT47B1P0C2W7 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CT47B1P0C2W7 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CT47B1P0C2W7 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CT47B1P0C2W7 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CT47B1P0C2W7 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CT47B1P0C2W7 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CT47B1P0C2W7 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CT47B1P0C2W7 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CT47B1P0C2W7 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CT47B1P0C2W7 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CT47B1P0C2W7 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CT47B1P0C2W7 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CT47B1P0C2W7 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CT47B1P0C2W7 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CT47B1P0C2W7 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CT47B1P0C2W7 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CT47B1P0C2W7 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CT47B1P0C2W7 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CT47B1P0C2W7 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CT47B1P0C2W7 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CT47B1P0C2W7 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CT47B1P0C2W7 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CT47B1P0C2W7 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CT47B1P0C2W7 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CT47B1P0C2W7 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CT47B1P0C2W7 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CT47B1P0C2W7 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CT47B1P0C2W7 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CT47B1P0C2W7 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CT47B1P0C2W7 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CT47B1P0C2W7 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CT47B1P0C2W7 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CT47B1P0C2W7 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CT47B1P0C2W7 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CT47B1P0C2W7 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CT47B1P0C2W7 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CT47B1P0C2W7 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CT47B1P0C2W7 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CT47B1P0C2W7 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CT47B1P0C2W7 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CT47B1P0C2W7 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CT47B1P0C2W7 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CT47B1P0C2W7 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms