Protein–RNA interactions for Protein: P08684

CYP3A4, Cytochrome P450 3A4, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP3A4P08684 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CYP3A4P08684 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CYP3A4P08684 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CYP3A4P08684 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CYP3A4P08684 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CYP3A4P08684 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CYP3A4P08684 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CYP3A4P08684 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CYP3A4P08684 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CYP3A4P08684 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CYP3A4P08684 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CYP3A4P08684 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CYP3A4P08684 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CYP3A4P08684 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CYP3A4P08684 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CYP3A4P08684 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CYP3A4P08684 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CYP3A4P08684 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CYP3A4P08684 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CYP3A4P08684 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CYP3A4P08684 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CYP3A4P08684 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CYP3A4P08684 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CYP3A4P08684 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CYP3A4P08684 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CYP3A4P08684 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CYP3A4P08684 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CYP3A4P08684 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CYP3A4P08684 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CYP3A4P08684 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CYP3A4P08684 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CYP3A4P08684 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CYP3A4P08684 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CYP3A4P08684 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CYP3A4P08684 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CYP3A4P08684 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CYP3A4P08684 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CYP3A4P08684 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CYP3A4P08684 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CYP3A4P08684 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CYP3A4P08684 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CYP3A4P08684 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CYP3A4P08684 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CYP3A4P08684 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CYP3A4P08684 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CYP3A4P08684 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CYP3A4P08684 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CYP3A4P08684 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CYP3A4P08684 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CYP3A4P08684 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CYP3A4P08684 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CYP3A4P08684 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CYP3A4P08684 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CYP3A4P08684 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CYP3A4P08684 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CYP3A4P08684 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CYP3A4P08684 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CYP3A4P08684 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CYP3A4P08684 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CYP3A4P08684 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CYP3A4P08684 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CYP3A4P08684 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CYP3A4P08684 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CYP3A4P08684 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CYP3A4P08684 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CYP3A4P08684 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CYP3A4P08684 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CYP3A4P08684 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CYP3A4P08684 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CYP3A4P08684 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CYP3A4P08684 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CYP3A4P08684 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CYP3A4P08684 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CYP3A4P08684 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CYP3A4P08684 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CYP3A4P08684 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CYP3A4P08684 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CYP3A4P08684 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CYP3A4P08684 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CYP3A4P08684 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CYP3A4P08684 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CYP3A4P08684 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CYP3A4P08684 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CYP3A4P08684 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CYP3A4P08684 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CYP3A4P08684 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CYP3A4P08684 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CYP3A4P08684 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CYP3A4P08684 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CYP3A4P08684 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CYP3A4P08684 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CYP3A4P08684 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CYP3A4P08684 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CYP3A4P08684 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CYP3A4P08684 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CYP3A4P08684 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CYP3A4P08684 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
CYP3A4P08684 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CYP3A4P08684 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CYP3A4P08684 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms