Protein–RNA interactions for Protein: P04198

MYCN, N-myc proto-oncogene protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYCNP04198 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MYCNP04198 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MYCNP04198 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
MYCNP04198 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MYCNP04198 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MYCNP04198 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MYCNP04198 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MYCNP04198 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MYCNP04198 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MYCNP04198 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MYCNP04198 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MYCNP04198 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MYCNP04198 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
MYCNP04198 AL355870.1-201ENST00000448272 454 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MYCNP04198 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MYCNP04198 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MYCNP04198 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MYCNP04198 AC087273.1-201ENST00000519368 529 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MYCNP04198 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MYCNP04198 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MYCNP04198 AC008147.4-201ENST00000617570 1204 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
MYCNP04198 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MYCNP04198 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MYCNP04198 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MYCNP04198 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MYCNP04198 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MYCNP04198 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MYCNP04198 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MYCNP04198 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MYCNP04198 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MYCNP04198 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MYCNP04198 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MYCNP04198 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
MYCNP04198 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MYCNP04198 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MYCNP04198 AC095032.2-201ENST00000414923 418 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MYCNP04198 NPM1P28-201ENST00000492269 840 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
MYCNP04198 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MYCNP04198 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MYCNP04198 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MYCNP04198 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MYCNP04198 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
MYCNP04198 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MYCNP04198 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
MYCNP04198 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MYCNP04198 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MYCNP04198 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
MYCNP04198 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MYCNP04198 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MYCNP04198 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MYCNP04198 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MYCNP04198 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
MYCNP04198 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MYCNP04198 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MYCNP04198 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MYCNP04198 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MYCNP04198 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MYCNP04198 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MYCNP04198 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MYCNP04198 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MYCNP04198 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MYCNP04198 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MYCNP04198 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MYCNP04198 AC099542.2-201ENST00000474149 553 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MYCNP04198 AC005954.1-201ENST00000591962 337 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MYCNP04198 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MYCNP04198 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MYCNP04198 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MYCNP04198 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MYCNP04198 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MYCNP04198 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
MYCNP04198 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MYCNP04198 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MYCNP04198 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MYCNP04198 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MYCNP04198 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MYCNP04198 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MYCNP04198 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MYCNP04198 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MYCNP04198 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MYCNP04198 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MYCNP04198 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MYCNP04198 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MYCNP04198 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MYCNP04198 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MYCNP04198 AC005972.3-201ENST00000606304 481 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
MYCNP04198 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MYCNP04198 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MYCNP04198 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MYCNP04198 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MYCNP04198 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MYCNP04198 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MYCNP04198 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MYCNP04198 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MYCNP04198 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MYCNP04198 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MYCNP04198 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MYCNP04198 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MYCNP04198 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
MYCNP04198 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms