Protein–RNA interactions for Protein: P02671

FGA, Fibrinogen alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGAP02671 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FGAP02671 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FGAP02671 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
FGAP02671 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FGAP02671 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FGAP02671 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FGAP02671 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FGAP02671 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FGAP02671 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FGAP02671 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FGAP02671 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FGAP02671 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FGAP02671 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FGAP02671 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FGAP02671 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FGAP02671 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FGAP02671 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FGAP02671 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FGAP02671 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FGAP02671 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FGAP02671 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FGAP02671 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
FGAP02671 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FGAP02671 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FGAP02671 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FGAP02671 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FGAP02671 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FGAP02671 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FGAP02671 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FGAP02671 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FGAP02671 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FGAP02671 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FGAP02671 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FGAP02671 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FGAP02671 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FGAP02671 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FGAP02671 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FGAP02671 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FGAP02671 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FGAP02671 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FGAP02671 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
FGAP02671 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FGAP02671 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FGAP02671 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FGAP02671 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FGAP02671 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FGAP02671 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FGAP02671 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FGAP02671 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FGAP02671 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FGAP02671 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FGAP02671 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FGAP02671 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FGAP02671 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FGAP02671 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FGAP02671 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FGAP02671 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FGAP02671 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FGAP02671 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FGAP02671 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FGAP02671 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FGAP02671 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FGAP02671 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FGAP02671 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FGAP02671 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FGAP02671 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FGAP02671 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FGAP02671 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FGAP02671 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FGAP02671 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FGAP02671 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FGAP02671 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
FGAP02671 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FGAP02671 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FGAP02671 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FGAP02671 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FGAP02671 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FGAP02671 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FGAP02671 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
FGAP02671 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FGAP02671 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FGAP02671 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FGAP02671 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
FGAP02671 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FGAP02671 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FGAP02671 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FGAP02671 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FGAP02671 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FGAP02671 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FGAP02671 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FGAP02671 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FGAP02671 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FGAP02671 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FGAP02671 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FGAP02671 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FGAP02671 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FGAP02671 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FGAP02671 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FGAP02671 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FGAP02671 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms