Protein–RNA interactions for Protein: O95237

LRAT, Lecithin retinol acyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRATO95237 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LRATO95237 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LRATO95237 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LRATO95237 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LRATO95237 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LRATO95237 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LRATO95237 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LRATO95237 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LRATO95237 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LRATO95237 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LRATO95237 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LRATO95237 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LRATO95237 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LRATO95237 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LRATO95237 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LRATO95237 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LRATO95237 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LRATO95237 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LRATO95237 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
LRATO95237 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LRATO95237 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LRATO95237 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LRATO95237 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LRATO95237 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LRATO95237 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LRATO95237 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LRATO95237 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LRATO95237 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LRATO95237 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LRATO95237 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LRATO95237 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LRATO95237 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LRATO95237 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LRATO95237 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LRATO95237 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LRATO95237 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LRATO95237 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LRATO95237 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LRATO95237 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LRATO95237 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LRATO95237 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LRATO95237 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
LRATO95237 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LRATO95237 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LRATO95237 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LRATO95237 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LRATO95237 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LRATO95237 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LRATO95237 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LRATO95237 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LRATO95237 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LRATO95237 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LRATO95237 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LRATO95237 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LRATO95237 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LRATO95237 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
LRATO95237 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LRATO95237 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LRATO95237 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
LRATO95237 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LRATO95237 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LRATO95237 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LRATO95237 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LRATO95237 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LRATO95237 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LRATO95237 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LRATO95237 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LRATO95237 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LRATO95237 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LRATO95237 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LRATO95237 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LRATO95237 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LRATO95237 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LRATO95237 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LRATO95237 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LRATO95237 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LRATO95237 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LRATO95237 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LRATO95237 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LRATO95237 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LRATO95237 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LRATO95237 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LRATO95237 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LRATO95237 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LRATO95237 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
LRATO95237 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LRATO95237 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LRATO95237 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LRATO95237 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LRATO95237 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LRATO95237 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LRATO95237 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LRATO95237 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LRATO95237 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LRATO95237 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LRATO95237 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LRATO95237 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LRATO95237 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LRATO95237 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LRATO95237 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms