Protein–RNA interactions for Protein: O94972

TRIM37, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM37, humanhuman

Predictions only

Length 964 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM37O94972 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRIM37O94972 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRIM37O94972 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRIM37O94972 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRIM37O94972 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRIM37O94972 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRIM37O94972 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
TRIM37O94972 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRIM37O94972 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRIM37O94972 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
TRIM37O94972 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRIM37O94972 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRIM37O94972 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRIM37O94972 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRIM37O94972 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRIM37O94972 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRIM37O94972 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRIM37O94972 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRIM37O94972 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRIM37O94972 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRIM37O94972 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRIM37O94972 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRIM37O94972 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
TRIM37O94972 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRIM37O94972 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRIM37O94972 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRIM37O94972 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRIM37O94972 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRIM37O94972 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRIM37O94972 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRIM37O94972 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIM37O94972 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIM37O94972 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIM37O94972 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIM37O94972 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIM37O94972 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIM37O94972 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIM37O94972 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIM37O94972 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIM37O94972 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIM37O94972 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIM37O94972 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIM37O94972 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIM37O94972 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRIM37O94972 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRIM37O94972 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRIM37O94972 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRIM37O94972 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRIM37O94972 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRIM37O94972 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRIM37O94972 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRIM37O94972 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRIM37O94972 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRIM37O94972 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIM37O94972 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIM37O94972 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIM37O94972 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIM37O94972 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIM37O94972 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIM37O94972 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIM37O94972 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIM37O94972 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIM37O94972 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIM37O94972 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIM37O94972 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIM37O94972 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIM37O94972 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIM37O94972 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIM37O94972 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIM37O94972 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIM37O94972 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIM37O94972 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIM37O94972 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIM37O94972 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIM37O94972 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIM37O94972 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIM37O94972 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIM37O94972 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIM37O94972 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIM37O94972 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIM37O94972 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIM37O94972 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIM37O94972 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIM37O94972 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIM37O94972 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIM37O94972 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRIM37O94972 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRIM37O94972 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRIM37O94972 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
TRIM37O94972 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRIM37O94972 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRIM37O94972 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRIM37O94972 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRIM37O94972 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
TRIM37O94972 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
TRIM37O94972 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRIM37O94972 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
TRIM37O94972 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRIM37O94972 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRIM37O94972 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms