Protein–RNA interactions for Protein: O76041

NEBL, Nebulette, humanhuman

Predictions only

Length 1,014 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEBLO76041 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NEBLO76041 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NEBLO76041 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NEBLO76041 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NEBLO76041 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NEBLO76041 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NEBLO76041 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
NEBLO76041 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NEBLO76041 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NEBLO76041 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NEBLO76041 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NEBLO76041 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NEBLO76041 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NEBLO76041 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
NEBLO76041 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NEBLO76041 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NEBLO76041 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NEBLO76041 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NEBLO76041 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NEBLO76041 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NEBLO76041 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NEBLO76041 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NEBLO76041 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
NEBLO76041 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NEBLO76041 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NEBLO76041 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NEBLO76041 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NEBLO76041 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NEBLO76041 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NEBLO76041 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NEBLO76041 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NEBLO76041 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
NEBLO76041 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NEBLO76041 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NEBLO76041 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NEBLO76041 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
NEBLO76041 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NEBLO76041 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NEBLO76041 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NEBLO76041 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NEBLO76041 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
NEBLO76041 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NEBLO76041 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NEBLO76041 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NEBLO76041 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NEBLO76041 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
NEBLO76041 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
NEBLO76041 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
NEBLO76041 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NEBLO76041 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NEBLO76041 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NEBLO76041 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NEBLO76041 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NEBLO76041 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NEBLO76041 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NEBLO76041 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NEBLO76041 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NEBLO76041 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NEBLO76041 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NEBLO76041 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NEBLO76041 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NEBLO76041 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
NEBLO76041 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NEBLO76041 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
NEBLO76041 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NEBLO76041 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NEBLO76041 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
NEBLO76041 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NEBLO76041 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NEBLO76041 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NEBLO76041 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NEBLO76041 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NEBLO76041 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NEBLO76041 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NEBLO76041 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NEBLO76041 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NEBLO76041 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NEBLO76041 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NEBLO76041 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NEBLO76041 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NEBLO76041 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NEBLO76041 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NEBLO76041 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NEBLO76041 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NEBLO76041 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NEBLO76041 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NEBLO76041 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NEBLO76041 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NEBLO76041 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NEBLO76041 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NEBLO76041 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NEBLO76041 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NEBLO76041 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NEBLO76041 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NEBLO76041 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NEBLO76041 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NEBLO76041 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NEBLO76041 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NEBLO76041 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NEBLO76041 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms