Protein–RNA interactions for Protein: O60682

MSC, Musculin, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSCO60682 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
MSCO60682 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MSCO60682 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MSCO60682 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MSCO60682 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MSCO60682 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MSCO60682 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MSCO60682 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MSCO60682 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MSCO60682 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MSCO60682 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MSCO60682 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MSCO60682 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
MSCO60682 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MSCO60682 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
MSCO60682 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
MSCO60682 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MSCO60682 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MSCO60682 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MSCO60682 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MSCO60682 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
MSCO60682 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MSCO60682 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MSCO60682 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MSCO60682 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
MSCO60682 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MSCO60682 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MSCO60682 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MSCO60682 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MSCO60682 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MSCO60682 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MSCO60682 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MSCO60682 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MSCO60682 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MSCO60682 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MSCO60682 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MSCO60682 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MSCO60682 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MSCO60682 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
MSCO60682 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MSCO60682 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MSCO60682 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MSCO60682 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MSCO60682 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
MSCO60682 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MSCO60682 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MSCO60682 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MSCO60682 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MSCO60682 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MSCO60682 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MSCO60682 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MSCO60682 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
MSCO60682 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MSCO60682 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MSCO60682 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MSCO60682 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC22■■□□□ 1.11
MSCO60682 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MSCO60682 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MSCO60682 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MSCO60682 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MSCO60682 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MSCO60682 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MSCO60682 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MSCO60682 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MSCO60682 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MSCO60682 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MSCO60682 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
MSCO60682 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MSCO60682 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MSCO60682 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MSCO60682 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MSCO60682 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MSCO60682 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MSCO60682 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MSCO60682 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MSCO60682 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MSCO60682 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MSCO60682 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MSCO60682 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MSCO60682 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MSCO60682 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MSCO60682 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MSCO60682 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MSCO60682 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MSCO60682 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MSCO60682 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MSCO60682 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MSCO60682 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MSCO60682 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MSCO60682 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
MSCO60682 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
MSCO60682 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MSCO60682 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MSCO60682 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MSCO60682 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MSCO60682 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MSCO60682 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MSCO60682 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MSCO60682 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MSCO60682 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms