Protein–RNA interactions for Protein: O60391

GRIN3B, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 3B, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN3BO60391 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GRIN3BO60391 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GRIN3BO60391 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GRIN3BO60391 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GRIN3BO60391 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GRIN3BO60391 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GRIN3BO60391 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GRIN3BO60391 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GRIN3BO60391 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GRIN3BO60391 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GRIN3BO60391 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GRIN3BO60391 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GRIN3BO60391 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GRIN3BO60391 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GRIN3BO60391 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GRIN3BO60391 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GRIN3BO60391 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GRIN3BO60391 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
GRIN3BO60391 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GRIN3BO60391 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GRIN3BO60391 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GRIN3BO60391 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GRIN3BO60391 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
GRIN3BO60391 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GRIN3BO60391 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GRIN3BO60391 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GRIN3BO60391 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GRIN3BO60391 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GRIN3BO60391 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GRIN3BO60391 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GRIN3BO60391 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GRIN3BO60391 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GRIN3BO60391 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GRIN3BO60391 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GRIN3BO60391 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GRIN3BO60391 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GRIN3BO60391 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GRIN3BO60391 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GRIN3BO60391 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GRIN3BO60391 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GRIN3BO60391 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GRIN3BO60391 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GRIN3BO60391 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GRIN3BO60391 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GRIN3BO60391 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GRIN3BO60391 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GRIN3BO60391 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GRIN3BO60391 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GRIN3BO60391 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GRIN3BO60391 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GRIN3BO60391 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GRIN3BO60391 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GRIN3BO60391 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
GRIN3BO60391 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GRIN3BO60391 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GRIN3BO60391 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
GRIN3BO60391 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GRIN3BO60391 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GRIN3BO60391 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GRIN3BO60391 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GRIN3BO60391 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GRIN3BO60391 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GRIN3BO60391 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
GRIN3BO60391 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
GRIN3BO60391 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
GRIN3BO60391 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
GRIN3BO60391 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GRIN3BO60391 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GRIN3BO60391 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GRIN3BO60391 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GRIN3BO60391 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GRIN3BO60391 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GRIN3BO60391 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GRIN3BO60391 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GRIN3BO60391 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GRIN3BO60391 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GRIN3BO60391 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GRIN3BO60391 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
GRIN3BO60391 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GRIN3BO60391 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
GRIN3BO60391 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GRIN3BO60391 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GRIN3BO60391 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GRIN3BO60391 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GRIN3BO60391 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GRIN3BO60391 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GRIN3BO60391 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GRIN3BO60391 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GRIN3BO60391 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
GRIN3BO60391 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
GRIN3BO60391 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GRIN3BO60391 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GRIN3BO60391 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GRIN3BO60391 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GRIN3BO60391 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GRIN3BO60391 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GRIN3BO60391 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GRIN3BO60391 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GRIN3BO60391 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
GRIN3BO60391 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms