Protein–RNA interactions for Protein: O60271

SPAG9, C-Jun-amino-terminal kinase-interacting protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,321 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPAG9O60271 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SPAG9O60271 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SPAG9O60271 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SPAG9O60271 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SPAG9O60271 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SPAG9O60271 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SPAG9O60271 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SPAG9O60271 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SPAG9O60271 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SPAG9O60271 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SPAG9O60271 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SPAG9O60271 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SPAG9O60271 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SPAG9O60271 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SPAG9O60271 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
SPAG9O60271 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SPAG9O60271 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SPAG9O60271 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
SPAG9O60271 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SPAG9O60271 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SPAG9O60271 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SPAG9O60271 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SPAG9O60271 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SPAG9O60271 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SPAG9O60271 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SPAG9O60271 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
SPAG9O60271 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SPAG9O60271 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SPAG9O60271 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
SPAG9O60271 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SPAG9O60271 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SPAG9O60271 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SPAG9O60271 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SPAG9O60271 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SPAG9O60271 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SPAG9O60271 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SPAG9O60271 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
SPAG9O60271 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SPAG9O60271 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SPAG9O60271 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
SPAG9O60271 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SPAG9O60271 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SPAG9O60271 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SPAG9O60271 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SPAG9O60271 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SPAG9O60271 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SPAG9O60271 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SPAG9O60271 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
SPAG9O60271 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SPAG9O60271 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SPAG9O60271 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SPAG9O60271 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SPAG9O60271 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SPAG9O60271 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
SPAG9O60271 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SPAG9O60271 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SPAG9O60271 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SPAG9O60271 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SPAG9O60271 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SPAG9O60271 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SPAG9O60271 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SPAG9O60271 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SPAG9O60271 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SPAG9O60271 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SPAG9O60271 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SPAG9O60271 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SPAG9O60271 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SPAG9O60271 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SPAG9O60271 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
SPAG9O60271 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.27
SPAG9O60271 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
SPAG9O60271 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
SPAG9O60271 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
SPAG9O60271 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
SPAG9O60271 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC29.2■■■□□ 2.27
SPAG9O60271 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
SPAG9O60271 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
SPAG9O60271 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
SPAG9O60271 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
SPAG9O60271 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
SPAG9O60271 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
SPAG9O60271 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
SPAG9O60271 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
SPAG9O60271 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
SPAG9O60271 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
SPAG9O60271 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SPAG9O60271 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SPAG9O60271 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SPAG9O60271 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SPAG9O60271 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SPAG9O60271 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SPAG9O60271 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SPAG9O60271 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
SPAG9O60271 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SPAG9O60271 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SPAG9O60271 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SPAG9O60271 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SPAG9O60271 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SPAG9O60271 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SPAG9O60271 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
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