Protein–RNA interactions for Protein: O43861

ATP9B, Probable phospholipid-transporting ATPase IIB, humanhuman

Predictions only

Length 1,147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP9BO43861 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP9BO43861 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP9BO43861 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP9BO43861 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP9BO43861 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP9BO43861 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP9BO43861 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP9BO43861 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP9BO43861 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP9BO43861 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP9BO43861 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP9BO43861 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP9BO43861 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP9BO43861 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP9BO43861 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP9BO43861 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP9BO43861 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP9BO43861 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP9BO43861 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP9BO43861 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP9BO43861 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP9BO43861 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP9BO43861 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP9BO43861 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP9BO43861 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP9BO43861 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATP9BO43861 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATP9BO43861 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATP9BO43861 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATP9BO43861 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATP9BO43861 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATP9BO43861 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATP9BO43861 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATP9BO43861 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATP9BO43861 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATP9BO43861 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATP9BO43861 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATP9BO43861 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATP9BO43861 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
ATP9BO43861 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATP9BO43861 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATP9BO43861 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATP9BO43861 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATP9BO43861 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATP9BO43861 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATP9BO43861 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATP9BO43861 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATP9BO43861 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATP9BO43861 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATP9BO43861 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATP9BO43861 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATP9BO43861 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATP9BO43861 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATP9BO43861 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATP9BO43861 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATP9BO43861 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATP9BO43861 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATP9BO43861 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATP9BO43861 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATP9BO43861 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATP9BO43861 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATP9BO43861 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATP9BO43861 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATP9BO43861 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATP9BO43861 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATP9BO43861 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
ATP9BO43861 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATP9BO43861 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATP9BO43861 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATP9BO43861 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATP9BO43861 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATP9BO43861 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATP9BO43861 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATP9BO43861 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATP9BO43861 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATP9BO43861 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATP9BO43861 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATP9BO43861 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATP9BO43861 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
ATP9BO43861 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATP9BO43861 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATP9BO43861 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATP9BO43861 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATP9BO43861 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATP9BO43861 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATP9BO43861 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATP9BO43861 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATP9BO43861 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATP9BO43861 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATP9BO43861 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATP9BO43861 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATP9BO43861 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATP9BO43861 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATP9BO43861 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATP9BO43861 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATP9BO43861 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATP9BO43861 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP9BO43861 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP9BO43861 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP9BO43861 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms