Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LRRTM2O43300 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LRRTM2O43300 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LRRTM2O43300 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LRRTM2O43300 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LRRTM2O43300 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LRRTM2O43300 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LRRTM2O43300 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LRRTM2O43300 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LRRTM2O43300 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LRRTM2O43300 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LRRTM2O43300 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LRRTM2O43300 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LRRTM2O43300 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LRRTM2O43300 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LRRTM2O43300 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LRRTM2O43300 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LRRTM2O43300 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LRRTM2O43300 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LRRTM2O43300 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LRRTM2O43300 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LRRTM2O43300 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LRRTM2O43300 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LRRTM2O43300 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LRRTM2O43300 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LRRTM2O43300 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LRRTM2O43300 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
LRRTM2O43300 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LRRTM2O43300 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LRRTM2O43300 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LRRTM2O43300 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LRRTM2O43300 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LRRTM2O43300 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LRRTM2O43300 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LRRTM2O43300 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
LRRTM2O43300 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LRRTM2O43300 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
LRRTM2O43300 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LRRTM2O43300 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LRRTM2O43300 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
LRRTM2O43300 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
LRRTM2O43300 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LRRTM2O43300 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LRRTM2O43300 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LRRTM2O43300 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LRRTM2O43300 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LRRTM2O43300 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LRRTM2O43300 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LRRTM2O43300 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LRRTM2O43300 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LRRTM2O43300 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LRRTM2O43300 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LRRTM2O43300 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LRRTM2O43300 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LRRTM2O43300 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LRRTM2O43300 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LRRTM2O43300 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LRRTM2O43300 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LRRTM2O43300 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LRRTM2O43300 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LRRTM2O43300 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LRRTM2O43300 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LRRTM2O43300 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LRRTM2O43300 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LRRTM2O43300 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LRRTM2O43300 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LRRTM2O43300 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LRRTM2O43300 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LRRTM2O43300 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
LRRTM2O43300 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LRRTM2O43300 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
LRRTM2O43300 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LRRTM2O43300 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LRRTM2O43300 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LRRTM2O43300 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LRRTM2O43300 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LRRTM2O43300 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LRRTM2O43300 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LRRTM2O43300 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LRRTM2O43300 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LRRTM2O43300 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LRRTM2O43300 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LRRTM2O43300 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LRRTM2O43300 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LRRTM2O43300 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LRRTM2O43300 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LRRTM2O43300 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LRRTM2O43300 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LRRTM2O43300 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LRRTM2O43300 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LRRTM2O43300 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LRRTM2O43300 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LRRTM2O43300 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
LRRTM2O43300 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LRRTM2O43300 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LRRTM2O43300 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LRRTM2O43300 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LRRTM2O43300 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LRRTM2O43300 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LRRTM2O43300 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
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